RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 ABCC5O15440 1437 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 ADGRB3O60242 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 KANK1Q14678 1352 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 ZFYVE9O95405 1425 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 RXRBP28702 533 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 BCANQ96GW7 911 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 SHPRHQ149N8 1683 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 DIP2AQ14689 1571 aa23.01■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 VPS8Q8N3P4 1428 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 TBX22Q9Y458 520 aa23■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 DAPK1P53355 1430 aa22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.98■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.97■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 BRINP3Q76B58 766 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.96■■□□□ 1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 AFF2P51816 1311 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.95■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 C14orf37Q86TY3 774 aa22.94■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 ATF3P18847 181 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.93■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 RGS12O14924 1447 aa22.92■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 PIK3R4Q99570 1358 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 PTPRUQ92729 1446 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 EP400Q96L91 3159 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 C8orf37Q96NL8 207 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 DCCP43146 1447 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 MST1RQ04912 1400 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 ADGRL2O95490 1459 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 TRPM2O94759 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 UNC13BO14795 1591 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.73■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.72■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 NGLY1Q96IV0 654 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 E9PCH4 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 ADAMTS2O95450 1211 aa22.7■■□□□ 1.22
RALGPS1-211ENST00000471643 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.68■■□□□ 1.22
RALGPS1-211ENST00000471643 METP08581 1390 aa22.67■■□□□ 1.22
RALGPS1-211ENST00000471643 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-211ENST00000471643 USP21Q9UK80 565 aa22.65■■□□□ 1.22
RALGPS1-211ENST00000471643 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 LAMC1P11047 1609 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 ATRNO75882 1429 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.62■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.61■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 APLP2Q06481 763 aa22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.58■■□□□ 1.21
RALGPS1-211ENST00000471643 PTCH1Q13635 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-211ENST00000471643 FOXD1Q16676 465 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-211ENST00000471643 ORAI2Q96SN7 254 aa22.57■■□□□ 1.2
RALGPS1-211ENST00000471643 CCDC125Q86Z20 511 aa22.56■■□□□ 1.2
RALGPS1-211ENST00000471643 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.54■■□□□ 1.2
RALGPS1-211ENST00000471643 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RALGPS1-211ENST00000471643 MYOM2P54296 1465 aa22.51■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 NUP155O75694 1391 aa22.5■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.47■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 ROCK1Q13464 1354 aa22.46■■□□□ 1.19
RALGPS1-211ENST00000471643 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RALGPS1-211ENST00000471643 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms