RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.67■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.65■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.65■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 TESK2Q96S53 571 aa18.64■□□□□ 0.58
GPC1-208ENST00000469694 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.64■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 ABCC3O15438 1527 aa18.64■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.64■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.63■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 IL27Q8NEV9 243 aa18.63■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 MADDQ8WXG6 1647 aa18.63■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.62■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 MRS2Q9HD23 443 aa18.62■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 MLECQ14165 292 aa18.6■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 MROH2AA6NES4 1674 aa18.58■□□□□ 0.57
GPC1-208ENST00000469694 NOS1P29475 1434 aa18.57■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.56■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.55■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.55■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 KIF1BO60333 1816 aa18.54■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 IDI1Q13907 227 aa18.54■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 TMF1P82094 1093 aa18.53■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.53■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.53■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 LAMC1P11047 1609 aa18.53■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 ADGRB3O60242 1522 aa18.52■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 STAC3Q96MF2 364 aa18.52■□□□□ 0.56
GPC1-208ENST00000469694 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.51■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 SYNMO15061 1565 aa18.5■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 PANK3Q9H999 370 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 MYOM2P54296 1465 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.49■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 USP35Q9P2H5 1018 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 IQGAP1P46940 1657 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.47■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.46■□□□□ 0.55
GPC1-208ENST00000469694 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.46■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 IFT172Q9UG01 1749 aa18.45■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.44■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 PIK3C2GO75747 1445 aa18.43■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 TMC1Q8TDI8 760 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 NUDCQ9Y266 331 aa18.42■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 PIK3C2BO00750 1634 aa18.41■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 NEFMP07197 916 aa18.41■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 PPLO60437 1756 aa18.4■□□□□ 0.54
GPC1-208ENST00000469694 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.39■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.39■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.38■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.38■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.37■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 RALBP1Q15311 655 aa18.37■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 STK26Q9P289 416 aa18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 ERVK-7P63135 1459 aa18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 AGLP35573 1532 aa18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.36■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 ADGRB1O14514 1584 aa18.35■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.34■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.34■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 REREQ9P2R6 1566 aa18.34■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 CDCA8Q53HL2 280 aa18.34■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
GPC1-208ENST00000469694 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.33■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.32■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.32■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 NLRP13Q86W25 1043 aa18.3■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.3■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 ZMYM3Q14202 1370 aa18.3■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.29■□□□□ 0.52
GPC1-208ENST00000469694 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms