RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNA6P17658 529 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 NOS1P29475 1434 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 ADGRB3O60242 1522 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 NUP155O75694 1391 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP1-204ENST00000459646 C14orf37Q86TY3 774 aa13.02□□□□□ -0.33
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SH3BP1-204ENST00000459646 UNC13BO14795 1591 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP1-204ENST00000459646 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP1-204ENST00000459646 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
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SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP1-204ENST00000459646 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.98□□□□□ -0.33
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SH3BP1-204ENST00000459646 FAM135BQ49AJ0 1406 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP1-204ENST00000459646 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP1-204ENST00000459646 PHLPP1O60346 1717 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP1-204ENST00000459646 NWD1Q149M9 1564 aa12.91□□□□□ -0.34
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SH3BP1-204ENST00000459646 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TRPM2O94759 1503 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.87□□□□□ -0.35
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SH3BP1-204ENST00000459646 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
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SH3BP1-204ENST00000459646 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-204ENST00000459646 NAIPQ13075 1403 aa12.84□□□□□ -0.35
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SH3BP1-204ENST00000459646 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-204ENST00000459646 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXD1Q16676 465 aa12.81□□□□□ -0.36
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SH3BP1-204ENST00000459646 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP1-204ENST00000459646 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
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SH3BP1-204ENST00000459646 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 STK26Q9P289 416 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 SHPRHQ149N8 1683 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC144AA2RUR9 1427 aa12.71□□□□□ -0.37
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SH3BP1-204ENST00000459646 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-204ENST00000459646 LRP6O75581 1613 aa12.71□□□□□ -0.37
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SH3BP1-204ENST00000459646 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.7□□□□□ -0.38
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SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-204ENST00000459646 AFF2P51816 1311 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-204ENST00000459646 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-204ENST00000459646 NGLY1Q96IV0 654 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-204ENST00000459646 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-204ENST00000459646 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
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SH3BP1-204ENST00000459646 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
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