RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.96■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.96■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.95■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMF1P82094 1093 aa23.92■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TESK2Q96S53 571 aa23.92■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.9■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.9■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.9■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.89■■□□□ 1.42
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.87■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIK3C2GO75747 1445 aa23.86■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC24A1O60721 1099 aa23.85■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.84■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERVK-7P63135 1459 aa23.84■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDCA8Q53HL2 280 aa23.84■■□□□ 1.41
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.81■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.81■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IDI1Q13907 227 aa23.81■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRS2Q9HD23 443 aa23.81■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.79■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZFYVE9O95405 1425 aa23.77■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.77■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RALBP1Q15311 655 aa23.76■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRB1O14514 1584 aa23.75■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MLECQ14165 292 aa23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC184Q52MB2 194 aa23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.73■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PANK3Q9H999 370 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYOM1P52179 1685 aa23.68■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.67■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZMYM3Q14202 1370 aa23.64■■□□□ 1.37
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.63■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMC1Q8TDI8 760 aa23.62■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.61■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.6■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NLRP13Q86W25 1043 aa23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.56■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.55■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ALKQ9UM73 1620 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TNRQ92752 1358 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.54■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.53■■□□□ 1.36
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EVC2Q86UK5 1308 aa23.49■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.47■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.46■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPRMP28827 1452 aa23.46■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NLRP1Q9C000 1473 aa23.45■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STK26Q9P289 416 aa23.44■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DLC1Q96QB1 1528 aa23.43■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C3P01024 1663 aa23.43■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEFLP07196 543 aa23.42■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 INSRP06213 1382 aa23.41■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.41■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POGKQ9P215 609 aa23.4■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 USP32Q8NFA0 1604 aa23.4■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.4■■□□□ 1.34
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.38■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP2R1AP30153 589 aa23.37■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRAM1Q96QH2 718 aa23.37■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.334e-6■■□□□ 13.5
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.36■■□□□ 1.33
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.35■■□□□ 1.33
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