RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.55■■□□□ 1.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LAMC1P11047 1609 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.51■■□□□ 1.03
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIK3C2GO75747 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP47Q96K76 1375 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.42■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.41■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.41■■□□□ 1.02
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IQGAP1P46940 1657 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLIT1O75093 1534 aa21.39■■□□□ 1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.37■■□□□ 1.01
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EID1Q9Y6B2 187 aa21.34■■□□□ 1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALKQ9UM73 1620 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADGRB1O14514 1584 aa21.33■■□□□ 1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.3■■□□□ 1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.3■■□□□ 1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.3■■□□□ 1
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LTKP29376 864 aa21.28■■□□□ 1
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.2■□□□□ 0.98
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TMF1P82094 1093 aa21.17■□□□□ 0.98
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.11■□□□□ 0.97
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CPS1P31327 1500 aa21.1■□□□□ 0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIK3R4Q99570 1358 aa21.09■□□□□ 0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PRAM1Q96QH2 718 aa21.08■□□□□ 0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.07■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PTPRUQ92729 1446 aa21.05■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EVC2Q86UK5 1308 aa21.04■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.03■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HSPA2P54652 639 aa21.02■□□□□ 0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.01■□□□□ 0.95
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