RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRB3O60242 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.18■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRP6O75581 1613 aa26.17■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOS1P29475 1434 aa26.16■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC5O15440 1437 aa26.14■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RXRBP28702 533 aa26.14■■□□□ 1.78
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.14■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.13■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.12■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf37Q86TY3 774 aa26.11■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.11■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBX22Q9Y458 520 aa26.08■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHPRHQ149N8 1683 aa26.08■■□□□ 1.77
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.07■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFYVE9O95405 1425 aa26.07■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAPK1P53355 1430 aa26.07■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATF3P18847 181 aa26.07■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.07■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.04■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.03■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3R4Q99570 1358 aa26■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.98■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AFF2P51816 1311 aa25.97■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRINP3Q76B58 766 aa25.96■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIP2AQ14689 1571 aa25.95■■□□□ 1.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.94■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.93■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.93■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCCP43146 1447 aa25.91■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.91■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.9■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS12O14924 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRL2O95490 1459 aa25.87■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APLP2Q06481 763 aa25.87■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXD1Q16676 465 aa25.87■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.87■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPM2O94759 1503 aa25.87■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.86■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C8orf37Q96NL8 207 aa25.85■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.85■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NGLY1Q96IV0 654 aa25.83■■□□□ 1.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.82■■□□□ 1.72
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.8■■□□□ 1.72
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MST1RQ04912 1400 aa25.8■■□□□ 1.72
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPRUQ92729 1446 aa25.8■■□□□ 1.72
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.79■■□□□ 1.72
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.78■■□□□ 1.72
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.76■■□□□ 1.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNC13BO14795 1591 aa25.73■■□□□ 1.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.7■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTS2O95450 1211 aa25.7■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 E9PCH4 1651 aa25.68■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.68■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP21Q9UK80 565 aa25.67■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.67■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC125Q86Z20 511 aa25.66■■□□□ 1.7
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.63■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 METP08581 1390 aa25.62■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTCH1Q13635 1447 aa25.62■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.6■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.6■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMC1P11047 1609 aa25.58■■□□□ 1.69
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATRNO75882 1429 aa25.57■■□□□ 1.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.55■■□□□ 1.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP155O75694 1391 aa25.55■■□□□ 1.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROCK1Q13464 1354 aa25.53■■□□□ 1.68
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORAI2Q96SN7 254 aa25.5■■□□□ 1.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EP400Q96L91 3159 aa25.48■■□□□ 1.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYOM2P54296 1465 aa25.45■■□□□ 1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.43■■□□□ 1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.43■■□□□ 1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.42■■□□□ 1.66
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