RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 KANK1Q14678 1352 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 RCAN3Q9UKA8 241 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE4AP27815 886 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.9□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TET3O43151 1660 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA6Q8N139 1617 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRB3O60242 1522 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CHD1O14646 1710 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R1AP30153 589 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PANK3Q9H999 370 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP152O94986 1710 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPY4P0CV99 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPY10P0CW01 314 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRB2O60241 1585 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 FANCAO15360 1455 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SLFN5Q08AF3 891 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC3O15438 1527 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3C2BO00750 1634 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 USP32Q8NFA0 1604 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 PLIN1O60240 522 aa4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 STAC3Q96MF2 364 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP5Q13017 1502 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TMC1Q8TDI8 760 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP7AQ04656 1500 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH2AA6NES4 1674 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 NOS1P29475 1434 aa4.86□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 NPATQ14207 1427 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMYM3Q14202 1370 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 AFAP1Q8N556 730 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CD163L1Q9NR16 1453 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.85□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CRBNQ96SW2 442 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 TULP4Q9NRJ4 1543 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 CD109Q6YHK3 1445 aa4.84□□□□□ -1.63
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRL1O94910 1474 aa4.84□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 USP35Q9P2H5 1018 aa4.84□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 MLH3Q9UHC1 1453 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC24BO95487 1268 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHDP01880 384 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 RLBP1P12271 317 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 DDIT3P35638 169 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 IL27Q8NEV9 243 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.83□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE9O95405 1425 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 RGL3Q3MIN7 710 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PPLO60437 1756 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 YEATS2Q9ULM3 1422 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa4.82□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 MED14O60244 1454 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAR3O75815 825 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.81□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 TMF1P82094 1093 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 TNNQ9UQP3 1299 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC27Q2M243 656 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 POGZQ7Z3K3 1410 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 NGEFQ8N5V2 710 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 WWC1Q8IX03 1113 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE3AQ14432 1141 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRMP28827 1452 aa4.8□□□□□ -1.64
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC11Q96J66 1382 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms