RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRZ1-201ENST00000393386 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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PTPRZ1-201ENST00000393386 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.78□□□□□ -1.32
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PTPRZ1-201ENST00000393386 TIGD1Q96MW7 591 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYO6Q9UM54 1294 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRZ1-201ENST00000393386 E9PSI1 815 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRZ1-201ENST00000393386 CCP110O43303 1012 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRZ1-201ENST00000393386 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRZ1-201ENST00000393386 CTR9Q6PD62 1173 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRZ1-201ENST00000393386 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.71□□□□□ -1.33
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PTPRZ1-201ENST00000393386 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 SETSIPP0DME0 302 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 PDE4AP27815 886 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRZ1-201ENST00000393386 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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