RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.8■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.79■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.79■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.78■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.78■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 TET3O43151 1660 aa22.77■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.77■■□□□ 1.24
TTC13-202ENST00000366662 NOS1P29475 1434 aa22.76■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 DEPDC5O75140 1603 aa22.75■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 CEP152O94986 1710 aa22.75■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.74■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.74■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.73■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 LAMC1P11047 1609 aa22.72■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.71■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 NPATQ14207 1427 aa22.71■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 SKAP1Q86WV1 359 aa22.71■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.71■■□□□ 1.23
TTC13-202ENST00000366662 CDCA8Q53HL2 280 aa22.7■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 IQGAP1P46940 1657 aa22.69■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 STK26Q9P289 416 aa22.68■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.68■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 MROH2AA6NES4 1674 aa22.67■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.67■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 ABCA6Q8N139 1617 aa22.65■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.64■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.64■■□□□ 1.22
TTC13-202ENST00000366662 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.63■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 ERVK-7P63135 1459 aa22.63■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 APAF1O14727 1248 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 IDI1Q13907 227 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 STAC3Q96MF2 364 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 KIF1BO60333 1816 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 NEUROD2Q15784 382 aa22.61■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.61■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 MLECQ14165 292 aa22.6■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 CRBNQ96SW2 442 aa22.59■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 PDE3BQ13370 1112 aa22.58■■□□□ 1.21
TTC13-202ENST00000366662 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.58■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 CABP2Q9NPB3 220 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.57■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 MYOM1P52179 1685 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 MORC1Q86VD1 984 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 MYOM2P54296 1465 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 SYNMO15061 1565 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC13-202ENST00000366662 ABCC3O15438 1527 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 GOLGA2Q08379 1002 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 ADGRB3O60242 1522 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 PIK3C2GO75747 1445 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.48■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 BCAR3O75815 825 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TTC13-202ENST00000366662 IFT172Q9UG01 1749 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 MTHFSP49914 203 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 SLFN5Q08AF3 891 aa22.43■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.43■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 ZNF521Q96K83 1311 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 TSPOAP1O95153 1857 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 PRAM1Q96QH2 718 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 NEO1Q92859 1461 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 PPLO60437 1756 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 ADGRB1O14514 1584 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 FBLN1P23142 703 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.39■■□□□ 1.18
TTC13-202ENST00000366662 POGKQ9P215 609 aa22.39■■□□□ 1.17
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