RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 OATP04181 439 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCM6Q14566 821 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCL2L12Q9HB09 334 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 PNMA3Q9UL41 463 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 POTEEQ6S8J3 1075 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 CERKQ8TCT0 537 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 HLA-CQ95604 372 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 HCSTQ9UBK5 93 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 NDUFV2P19404 249 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPREP23469 700 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 PBX2P40425 430 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOMEZQ8IX15 550 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 TATDN2Q93075 761 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARXQ96QS3 562 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOPCQ9HD26 462 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNRKQ9NRH2 765 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 MOXD2PA6NHM9 499 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD46P15529 392 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 GUCA2AQ02747 115 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFC5P40937 340 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 QPCTQ16769 361 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 NBPF26B4DH59 902 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 APBB1O00213 710 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 FLIIQ13045 1269 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 RIC3Q7Z5B4 369 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 RDH13Q8NBN7 331 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC10A3P09131 477 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJB2P25686 324 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAK2O60296 914 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 PACS2Q86VP3 889 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPTLC1O15269 473 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 COG6Q9Y2V7 657 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-487P-201ENST00000365430 A6NJR5 290 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF40O75150 1001 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXA2O43364 376 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 LILRB3O75022 631 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP1G2O75843 785 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS20O76081 388 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 SULF1Q8IWU6 871 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPDYE5A6NIY4 337 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 POM121CA8CG34 1229 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 KDM4AO75164 1064 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP17L8P0C7I0 530 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 HRCP23327 699 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 GCGRP47871 477 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP33O14559 1287 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 FDX1P10109 184 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 ABL2P42684 1182 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSC1Q92574 1164 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 TK2O00142 265 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFHP08603 1231 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 FUT2Q10981 343 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-487P-201ENST00000365430 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.7 ms