RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.36■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.36■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 PPLO60437 1756 aa27.35■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 TSPOAP1O95153 1857 aa27.34■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 NOS1P29475 1434 aa27.34■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.33■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 PIK3C2BO00750 1634 aa27.33■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.33■■□□□ 1.97
SERBP1-201ENST00000361219 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.32■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.31■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 NEFLP07196 543 aa27.3■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 FKBP8Q14318 412 aa27.29■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 SYNMO15061 1565 aa27.28■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.28■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 TMC1Q8TDI8 760 aa27.28■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.27■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 CDCA8Q53HL2 280 aa27.26■■□□□ 1.96
SERBP1-201ENST00000361219 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.26■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.25■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 PANK3Q9H999 370 aa27.25■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.24■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 PIK3C2GO75747 1445 aa27.23■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 MYOM1P52179 1685 aa27.22■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 REREQ9P2R6 1566 aa27.22■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 NLRP13Q86W25 1043 aa27.21■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 SLC24A1O60721 1099 aa27.2■■□□□ 1.95
SERBP1-201ENST00000361219 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.18■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.16■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.16■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 ADGRB1O14514 1584 aa27.16■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 AGLP35573 1532 aa27.15■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 ERVK-7P63135 1459 aa27.15■■□□□ 1.94
SERBP1-201ENST00000361219 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.11■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 BCANQ96GW7 911 aa27.11■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.09■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 IDI1Q13907 227 aa27.08■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.08■■□□□ 1.93
SERBP1-201ENST00000361219 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.07■■□□□ 1.92
SERBP1-201ENST00000361219 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.07■■□□□ 1.92
SERBP1-201ENST00000361219 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.07■■□□□ 1.92
SERBP1-201ENST00000361219 ZFYVE9O95405 1425 aa27.06■■□□□ 1.92
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SERBP1-201ENST00000361219 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.04■■□□□ 1.92
SERBP1-201ENST00000361219 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SERBP1-201ENST00000361219 INSRP06213 1382 aa27.04■■□□□ 1.92
SERBP1-201ENST00000361219 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.02■■□□□ 1.92
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SERBP1-201ENST00000361219 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SERBP1-201ENST00000361219 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.99■■□□□ 1.91
SERBP1-201ENST00000361219 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.99■■□□□ 1.91
SERBP1-201ENST00000361219 NUDCQ9Y266 331 aa26.99■■□□□ 1.91
SERBP1-201ENST00000361219 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.97■■□□□ 1.91
SERBP1-201ENST00000361219 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
SERBP1-201ENST00000361219 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SERBP1-201ENST00000361219 PPP2R1AP30153 589 aa26.93■■□□□ 1.9
SERBP1-201ENST00000361219 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SERBP1-201ENST00000361219 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.93■■□□□ 1.9
SERBP1-201ENST00000361219 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SERBP1-201ENST00000361219 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.87■■□□□ 1.89
SERBP1-201ENST00000361219 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.86■■□□□ 1.89
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SERBP1-201ENST00000361219 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.85■■□□□ 1.89
SERBP1-201ENST00000361219 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.85■■□□□ 1.89
SERBP1-201ENST00000361219 PDE3BQ13370 1112 aa26.83■■□□□ 1.89
SERBP1-201ENST00000361219 USP32Q8NFA0 1604 aa26.83■■□□□ 1.89
SERBP1-201ENST00000361219 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.81■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 EVC2Q86UK5 1308 aa26.81■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 ALKQ9UM73 1620 aa26.81■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.8■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 PTPRMP28827 1452 aa26.79■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 MLECQ14165 292 aa26.78■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.78■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.78■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.78■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.883e-6■■■■□ 24.3
SERBP1-201ENST00000361219 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.77■■□□□ 1.88
SERBP1-201ENST00000361219 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.76■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 ZMYM3Q14202 1370 aa26.72■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.72■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 STK26Q9P289 416 aa26.71■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.71■■□□□ 1.87
SERBP1-201ENST00000361219 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.7■■□□□ 1.86
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