RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356990.9

RNF19B-202, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-202ENST00000356990 PLXNC1O60486 1568 aa30.65■■■□□ 2.5
RNF19B-202ENST00000356990 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.64■■■□□ 2.5
RNF19B-202ENST00000356990 PPP2R1AP30153 589 aa30.64■■■□□ 2.5
RNF19B-202ENST00000356990 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 ZNF521Q96K83 1311 aa30.63■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 PLCH2O75038 1416 aa30.63■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 GOLGA2Q08379 1002 aa30.62■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 LAMC1P11047 1609 aa30.62■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 AFAP1Q8N556 730 aa30.61■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.61■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.61■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.59■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.58■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
RNF19B-202ENST00000356990 SLFN5Q08AF3 891 aa30.55■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.54■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 ABCC1P33527 1531 aa30.53■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.52■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.51■■■□□ 2.48
RNF19B-202ENST00000356990 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
RNF19B-202ENST00000356990 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
RNF19B-202ENST00000356990 BCAR3O75815 825 aa30.49■■■□□ 2.47
RNF19B-202ENST00000356990 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
RNF19B-202ENST00000356990 ATP10AO60312 1499 aa30.44■■■□□ 2.46
RNF19B-202ENST00000356990 IGHDP01880 384 aa30.44■■■□□ 2.46
RNF19B-202ENST00000356990 APAF1O14727 1248 aa30.43■■■□□ 2.46
RNF19B-202ENST00000356990 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.42■■■□□ 2.46
RNF19B-202ENST00000356990 USP19O94966 1318 aa30.42■■■□□ 2.46
RNF19B-202ENST00000356990 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
RNF19B-202ENST00000356990 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.38■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 SEC24BO95487 1268 aa30.37■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.37■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 PIK3C2GO75747 1445 aa30.36■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.35■■■□□ 2.45
RNF19B-202ENST00000356990 MADDQ8WXG6 1647 aa30.31■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 E9PSI1 815 aa30.31■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 KIF3BO15066 747 aa30.31■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 CDCA8Q53HL2 280 aa30.31■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 POGKQ9P215 609 aa30.3■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 CLTCL1P53675 1640 aa30.3■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 SYNMO15061 1565 aa30.29■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 FANCAO15360 1455 aa30.28■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.28■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 PANK1Q8TE04 598 aa30.27■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 IQGAP1P46940 1657 aa30.27■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 COG6Q9Y2V7 657 aa30.27■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 TRPM2O94759 1503 aa30.27■■■□□ 2.44
RNF19B-202ENST00000356990 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.26■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.25■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.25■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.25■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.24■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.24■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.23■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 PDE3AQ14432 1141 aa30.23■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 ATP7AQ04656 1500 aa30.23■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 CEP152O94986 1710 aa30.22■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 PTPRTO14522 1441 aa30.21■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa30.21■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 MYOM1P52179 1685 aa30.2■■■□□ 2.43
RNF19B-202ENST00000356990 DEPDC5O75140 1603 aa30.2■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 BECN1Q14457 450 aa30.19■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 ADGRL1O94910 1474 aa30.19■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.17■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.17■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 NLRP1Q9C000 1473 aa30.17■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 WWC1Q8IX03 1113 aa30.16■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 TET3O43151 1660 aa30.16■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.15■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.15■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 KANK1Q14678 1352 aa30.14■■■□□ 2.42
RNF19B-202ENST00000356990 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.13■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.12■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 ASXL2Q76L83 1435 aa30.12■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.1■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.1■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 NEUROD2Q15784 382 aa30.1■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 RSPH6AQ9H0K4 717 aa30.1■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 TNNQ9UQP3 1299 aa30.1■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.09■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.09■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 NGEFQ8N5V2 710 aa30.09■■■□□ 2.41
RNF19B-202ENST00000356990 RLBP1P12271 317 aa30.07■■■□□ 2.4
RNF19B-202ENST00000356990 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
RNF19B-202ENST00000356990 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa30.06■■■□□ 2.4
RNF19B-202ENST00000356990 TBC1D2Q9BYX2 928 aa30.06■■■□□ 2.4
RNF19B-202ENST00000356990 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
RNF19B-202ENST00000356990 TBC1D32Q96NH3 1257 aa30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms