RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.46■■■□□ 2.47
C9orf163-201ENST00000354376 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.44■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 KIF1BO60333 1816 aa30.43■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.43■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 NUDCQ9Y266 331 aa30.43■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 STAC3Q96MF2 364 aa30.42■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 BCL11AQ9H165 835 aa30.42■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.42■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 NOS1P29475 1434 aa30.4■■■□□ 2.46
C9orf163-201ENST00000354376 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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C9orf163-201ENST00000354376 NEO1Q92859 1461 aa30.35■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 ABCC3O15438 1527 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 IFT172Q9UG01 1749 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 KNSTRNQ9Y448 316 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf163-201ENST00000354376 ADGRB3O60242 1522 aa30.32■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.31■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.31■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.31■■■□□ 2.44
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C9orf163-201ENST00000354376 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.3■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.29■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.28■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.28■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 MYOM1P52179 1685 aa30.27■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 CDCA8Q53HL2 280 aa30.27■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 ERVK-7P63135 1459 aa30.26■■■□□ 2.44
C9orf163-201ENST00000354376 RICTORQ6R327 1708 aa30.26■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 PPP2R1AP30153 589 aa30.25■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.24■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 SYNMO15061 1565 aa30.24■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.24■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.23■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.23■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.21■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.2■■■□□ 2.43
C9orf163-201ENST00000354376 PIK3C2GO75747 1445 aa30.2■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 PPLO60437 1756 aa30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 IDI1Q13907 227 aa30.17■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.16■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
C9orf163-201ENST00000354376 ADGRB1O14514 1584 aa30.11■■■□□ 2.41
C9orf163-201ENST00000354376 TSPOAP1O95153 1857 aa30.11■■■□□ 2.41
C9orf163-201ENST00000354376 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
C9orf163-201ENST00000354376 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf163-201ENST00000354376 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.08■■■□□ 2.41
C9orf163-201ENST00000354376 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 PIK3C2BO00750 1634 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 GLI2P10070 1586 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.05■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 DIP2BQ9P265 1576 aa30.04■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.02■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
C9orf163-201ENST00000354376 PDE3BQ13370 1112 aa30.01■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 STK26Q9P289 416 aa30.01■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.99■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 SLC24A1O60721 1099 aa29.97■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.97■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 PLIN1O60240 522 aa29.97■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 MLECQ14165 292 aa29.97■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.96■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 INSRP06213 1382 aa29.96■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.96■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.95■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.95■■■□□ 2.39
C9orf163-201ENST00000354376 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.94■■■□□ 2.38
C9orf163-201ENST00000354376 CABP2Q9NPB3 220 aa29.93■■■□□ 2.38
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.88■■■□□ 2.37
C9orf163-201ENST00000354376 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
C9orf163-201ENST00000354376 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.88■■■□□ 2.37
C9orf163-201ENST00000354376 APAF1O14727 1248 aa29.86■■■□□ 2.37
C9orf163-201ENST00000354376 MORC1Q86VD1 984 aa29.85■■■□□ 2.37
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF521Q96K83 1311 aa29.84■■■□□ 2.37
C9orf163-201ENST00000354376 EVC2Q86UK5 1308 aa29.83■■■□□ 2.37
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