RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 C8orf34Q49A92 452 aa23.7■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.69■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.69■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.68■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 ERCC6Q03468 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.66■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 PPP2R1AP30153 589 aa23.66■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.66■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.65■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.65■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 ZMYM3Q14202 1370 aa23.65■■□□□ 1.38
KRCC1-201ENST00000347055 SLFN5Q08AF3 891 aa23.64■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.64■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 SLC24A1O60721 1099 aa23.63■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 MYOM1P52179 1685 aa23.62■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.62■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 CEP152O94986 1710 aa23.61■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 TRPM2O94759 1503 aa23.61■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.6■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 AAMPQ13685 434 aa23.6■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 RGL3Q3MIN7 710 aa23.6■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
KRCC1-201ENST00000347055 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.36
KRCC1-201ENST00000347055 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.57■■□□□ 1.36
KRCC1-201ENST00000347055 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
KRCC1-201ENST00000347055 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
KRCC1-201ENST00000347055 E9PSI1 815 aa23.55■■□□□ 1.36
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KRCC1-201ENST00000347055 SHROOM2Q13796 1616 aa23.52■■□□□ 1.36
KRCC1-201ENST00000347055 PTPRTO14522 1441 aa23.51■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 SKAP1Q86WV1 359 aa23.5■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.5■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.5■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 BECN1Q14457 450 aa23.5■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 DEPDC5O75140 1603 aa23.49■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 ABCC1P33527 1531 aa23.46■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 TET3O43151 1660 aa23.46■■□□□ 1.35
KRCC1-201ENST00000347055 SLC4A3P48751 1232 aa23.45■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.44■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.44■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 MYOM2P54296 1465 aa23.43■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 FBLN2P98095 1184 aa23.43■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 USP19O94966 1318 aa23.42■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 CLTCL1P53675 1640 aa23.42■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.42■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 RGS3P49796 1198 aa23.42■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.42■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 NLRP1Q9C000 1473 aa23.41■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 PLCH2O75038 1416 aa23.41■■□□□ 1.34
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KRCC1-201ENST00000347055 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.4■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.4■■□□□ 1.34
KRCC1-201ENST00000347055 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.38■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.38■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.37■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 APAF1O14727 1248 aa23.36■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 ERVK-7P63135 1459 aa23.35■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 USP32Q8NFA0 1604 aa23.34■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 IGHDP01880 384 aa23.33■■□□□ 1.33
KRCC1-201ENST00000347055 KANK1Q14678 1352 aa23.33■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.33■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 BCAR3O75815 825 aa23.32■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 SHPRHQ149N8 1683 aa23.32■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 IFT172Q9UG01 1749 aa23.32■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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KRCC1-201ENST00000347055 ABCA6Q8N139 1617 aa23.3■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.3■■□□□ 1.32
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KRCC1-201ENST00000347055 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.29■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.28■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.28■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.28■■□□□ 1.32
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KRCC1-201ENST00000347055 WWC1Q8IX03 1113 aa23.27■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.27■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 WDR63Q8IWG1 891 aa23.27■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC27Q2M243 656 aa23.26■■□□□ 1.31
KRCC1-201ENST00000347055 ADGRL1O94910 1474 aa23.25■■□□□ 1.31
KRCC1-201ENST00000347055 KIF1BO60333 1816 aa23.24■■□□□ 1.31
KRCC1-201ENST00000347055 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
KRCC1-201ENST00000347055 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
KRCC1-201ENST00000347055 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.23■■□□□ 1.31
KRCC1-201ENST00000347055 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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