RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ZMYM3Q14202 1370 aa8.53□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.53□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.53□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 MYOM2P54296 1465 aa8.52□□□□□ -1.04
CCR6-201ENST00000341935 LAMC1P11047 1609 aa8.52□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 STAC3Q96MF2 364 aa8.52□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.52□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 C3P01024 1663 aa8.52□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 IDI1Q13907 227 aa8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.5□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.5□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.5□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.49□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.49□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 USP47Q96K76 1375 aa8.49□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.49□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 TNRQ92752 1358 aa8.48□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.48□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.47□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 IQGAP1P46940 1657 aa8.47□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.47□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.47□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 PIK3C2GO75747 1445 aa8.47□□□□□ -1.05
CCR6-201ENST00000341935 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 ZFYVE9O95405 1425 aa8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 NLRP1Q9C000 1473 aa8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.44□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 PDE4CQ08493 712 aa8.44□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 NEFLP07196 543 aa8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 HOMEZQ8IX15 550 aa8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.43□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.42□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 ADGRB1O14514 1584 aa8.42□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 CCDC7Q96M83 1385 aa8.42□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.41□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 ALKQ9UM73 1620 aa8.41□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.4□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CCR6-201ENST00000341935 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.4□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 SLIT1O75093 1534 aa8.39□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 TESK2Q96S53 571 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 PTPRMP28827 1452 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 C14orf37Q86TY3 774 aa8.38□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 MIER1Q8N108 512 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.37□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.36□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.35□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 TMF1P82094 1093 aa8.35□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.35□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 LTKP29376 864 aa8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 EID1Q9Y6B2 187 aa8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.34□□□□□ -1.07
CCR6-201ENST00000341935 DLC1Q96QB1 1528 aa8.33□□□□□ -1.08
CCR6-201ENST00000341935 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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