RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.49■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 PPLO60437 1756 aa22.48■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 SLC24A1O60721 1099 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 TESK2Q96S53 571 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.44■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 ERVK-7P63135 1459 aa22.43■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 ZFYVE9O95405 1425 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 PIK3C2GO75747 1445 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 TMF1P82094 1093 aa22.42■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 IDI1Q13907 227 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HPS1-202ENST00000338546 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.39■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 CDCA8Q53HL2 280 aa22.38■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.37■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.34■■□□□ 1.17
HPS1-202ENST00000338546 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.32■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.32■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.32■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 ADGRB1O14514 1584 aa22.3■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 ZMYM3Q14202 1370 aa22.29■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 MLECQ14165 292 aa22.27■■□□□ 1.16
HPS1-202ENST00000338546 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.27■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 RALBP1Q15311 655 aa22.25■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HPS1-202ENST00000338546 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 MRS2Q9HD23 443 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 TNRQ92752 1358 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 PANK3Q9H999 370 aa22.17■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.16■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.14■■□□□ 1.14
HPS1-202ENST00000338546 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 NLRP1Q9C000 1473 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 CCDC184Q52MB2 194 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 MYOM1P52179 1685 aa22.12■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 ALKQ9UM73 1620 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.08■■□□□ 1.13
HPS1-202ENST00000338546 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 NLRP13Q86W25 1043 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 EVC2Q86UK5 1308 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 TMC1Q8TDI8 760 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 DLC1Q96QB1 1528 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 C3P01024 1663 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 PTPRMP28827 1452 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HPS1-202ENST00000338546 NINLQ9Y2I6 1382 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 INSRP06213 1382 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 ABCC11Q96J66 1382 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 SIRT1Q96EB6 747 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.97■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 STK26Q9P289 416 aa21.95■■□□□ 1.11
HPS1-202ENST00000338546 POGKQ9P215 609 aa21.95■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 SLIT1O75093 1534 aa21.94■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 PRAM1Q96QH2 718 aa21.94■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 USP32Q8NFA0 1604 aa21.93■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 TECPR2O15040 1411 aa21.92■■□□□ 1.1
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