RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 CXorf38Q8TB03 319 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 PLEKHG3A1L390 1219 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 APPP05067 770 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 PMM1Q92871 262 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 VTI1AQ96AJ9 217 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 POLD1P28340 1107 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 TRIM41Q8WV44 630 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 GOLIM4O00461 696 aa8.99□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 GPATCH3Q96I76 525 aa8.99□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.99□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 ZNF280DQ6N043 979 aa8.98□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.98□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.98□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 POM121Q96HA1 1249 aa8.98□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 TRIM66O15016 1216 aa8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
RRN3-202ENST00000327307 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 RHBDL3P58872 404 aa8.96□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 FOXD1Q16676 465 aa8.96□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 POLA2Q14181 598 aa8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 SETDB1Q15047 1291 aa8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 JADE2Q9NQC1 790 aa8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.95□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 DPH6Q7L8W6 267 aa8.94□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.94□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.94□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.93□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 PSEN1P49768 467 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 MKL1Q969V6 931 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 SEMA3FQ13275 785 aa8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 C4orf46Q504U0 113 aa8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 BDNFP23560 247 aa8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 PSME1Q06323 249 aa8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.9□□□□□ -0.98
RRN3-202ENST00000327307 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 IGBP1P78318 339 aa8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.89□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 CARNS1A5YM72 827 aa8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 SCP2P22307 547 aa8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 COPB2P35606 906 aa8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 GYS2P54840 703 aa8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RRN3-202ENST00000327307 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms