RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.58■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.57■■■□□ 2.96
TMIE-201ENST00000326431 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.56■■■□□ 2.96
TMIE-201ENST00000326431 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.55■■■□□ 2.96
TMIE-201ENST00000326431 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.55■■■□□ 2.96
TMIE-201ENST00000326431 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
TMIE-201ENST00000326431 TNRQ92752 1358 aa33.48■■■□□ 2.95
TMIE-201ENST00000326431 IQGAP1P46940 1657 aa33.46■■■□□ 2.95
TMIE-201ENST00000326431 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
TMIE-201ENST00000326431 PIK3C2GO75747 1445 aa33.45■■■□□ 2.95
TMIE-201ENST00000326431 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.44■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.43■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.43■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.41■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.41■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 ZFYVE9O95405 1425 aa33.39■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.39■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.39■■■□□ 2.94
TMIE-201ENST00000326431 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa33.36■■■□□ 2.93
TMIE-201ENST00000326431 CCDC7Q96M83 1385 aa33.35■■■□□ 2.93
TMIE-201ENST00000326431 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.33■■■□□ 2.93
TMIE-201ENST00000326431 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
TMIE-201ENST00000326431 NLRP1Q9C000 1473 aa33.33■■■□□ 2.93
TMIE-201ENST00000326431 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
TMIE-201ENST00000326431 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.3■■■□□ 2.92
TMIE-201ENST00000326431 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.3■■■□□ 2.92
TMIE-201ENST00000326431 ADGRB1O14514 1584 aa33.28■■■□□ 2.92
TMIE-201ENST00000326431 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.27■■■□□ 2.92
TMIE-201ENST00000326431 MIER1Q8N108 512 aa33.25■■■□□ 2.91
TMIE-201ENST00000326431 TESK2Q96S53 571 aa33.21■■■□□ 2.91
TMIE-201ENST00000326431 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 ALKQ9UM73 1620 aa33.19■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.18■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.18■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.17■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa33.15■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.14■■■□□ 2.9
TMIE-201ENST00000326431 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.12■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.09■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 SLIT1O75093 1534 aa33.09■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 PTPRMP28827 1452 aa33.09■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.08■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 TMF1P82094 1093 aa33.07■■■□□ 2.89
TMIE-201ENST00000326431 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.07■■■□□ 2.88
TMIE-201ENST00000326431 LTKP29376 864 aa33.02■■■□□ 2.88
TMIE-201ENST00000326431 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
TMIE-201ENST00000326431 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
TMIE-201ENST00000326431 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa32.99■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.98■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.97■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 STK26Q9P289 416 aa32.97■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 ANP32CO43423 234 aa32.95■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 EID1Q9Y6B2 187 aa32.95■■■□□ 2.87
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.93■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 SLC24A1O60721 1099 aa32.92■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 BCANQ96GW7 911 aa32.92■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 METP08581 1390 aa32.92■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 MYOM1P52179 1685 aa32.9■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 CDCA8Q53HL2 280 aa32.89■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.89■■■□□ 2.86
TMIE-201ENST00000326431 DLC1Q96QB1 1528 aa32.88■■■□□ 2.85
TMIE-201ENST00000326431 MED14O60244 1454 aa32.86■■■□□ 2.85
TMIE-201ENST00000326431 ABCC11Q96J66 1382 aa32.84■■■□□ 2.85
TMIE-201ENST00000326431 PRAM1Q96QH2 718 aa32.83■■■□□ 2.85
TMIE-201ENST00000326431 TULP4Q9NRJ4 1543 aa32.83■■■□□ 2.85
TMIE-201ENST00000326431 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP32.82■■■□□ 2.84
TMIE-201ENST00000326431 DIP2AQ14689 1571 aa32.8■■■□□ 2.84
TMIE-201ENST00000326431 POGKQ9P215 609 aa32.79■■■□□ 2.84
TMIE-201ENST00000326431 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.79■■■□□ 2.84
TMIE-201ENST00000326431 CPS1P31327 1500 aa32.79■■■□□ 2.84
TMIE-201ENST00000326431 TECPR2O15040 1411 aa32.77■■■□□ 2.84
TMIE-201ENST00000326431 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.74■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 PANK3Q9H999 370 aa32.74■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa32.74■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 EVC2Q86UK5 1308 aa32.74■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.74■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 TBX22Q9Y458 520 aa32.73■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.72■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 PTPRUQ92729 1446 aa32.72■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 CCER2I3L3R5 266 aa32.72■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
TMIE-201ENST00000326431 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms