RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326407.10

ITM2C-201, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-201ENST00000326407 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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ITM2C-201ENST00000326407 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.77■■□□□ 1.24
ITM2C-201ENST00000326407 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.76■■□□□ 1.23
ITM2C-201ENST00000326407 RGL3Q3MIN7 710 aa22.76■■□□□ 1.23
ITM2C-201ENST00000326407 NOS1P29475 1434 aa22.75■■□□□ 1.23
ITM2C-201ENST00000326407 ERVK-7P63135 1459 aa22.75■■□□□ 1.23
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ITM2C-201ENST00000326407 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.74■■□□□ 1.23
ITM2C-201ENST00000326407 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.73■■□□□ 1.23
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ITM2C-201ENST00000326407 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.73■■□□□ 1.23
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ITM2C-201ENST00000326407 TRPM2O94759 1503 aa22.68■■□□□ 1.22
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ITM2C-201ENST00000326407 IDI1Q13907 227 aa22.62■■□□□ 1.21
ITM2C-201ENST00000326407 PIK3C2BO00750 1634 aa22.62■■□□□ 1.21
ITM2C-201ENST00000326407 CLTCL1P53675 1640 aa22.61■■□□□ 1.21
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ITM2C-201ENST00000326407 NLRP1Q9C000 1473 aa22.61■■□□□ 1.21
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ITM2C-201ENST00000326407 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.54■■□□□ 1.2
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ITM2C-201ENST00000326407 ADGRB3O60242 1522 aa22.5■■□□□ 1.19
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ITM2C-201ENST00000326407 SLIT1O75093 1534 aa22.39■■□□□ 1.18
ITM2C-201ENST00000326407 NLRP13Q86W25 1043 aa22.39■■□□□ 1.18
ITM2C-201ENST00000326407 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.39■■□□□ 1.18
ITM2C-201ENST00000326407 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.39■■□□□ 1.17
ITM2C-201ENST00000326407 IFT172Q9UG01 1749 aa22.39■■□□□ 1.17
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ITM2C-201ENST00000326407 ZFYVE9O95405 1425 aa22.38■■□□□ 1.17
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ITM2C-201ENST00000326407 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
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ITM2C-201ENST00000326407 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.32■■□□□ 1.16
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ITM2C-201ENST00000326407 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.3■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 INSRP06213 1382 aa22.3■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 PANK3Q9H999 370 aa22.28■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 MYOM1P52179 1685 aa22.28■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.27■■□□□ 1.16
ITM2C-201ENST00000326407 CDCA8Q53HL2 280 aa22.26■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.26■■□□□ 1.15
ITM2C-201ENST00000326407 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.26■■□□□ 1.15
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