RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.55■■■□□ 2.64
CTU2-201ENST00000312060 MYOM2P54296 1465 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-201ENST00000312060 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.54■■■□□ 2.64
CTU2-201ENST00000312060 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.5■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.48■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.46■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.45■■■□□ 2.63
CTU2-201ENST00000312060 RIMS2Q9UQ26 1411 aa31.44■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 ZFYVE9O95405 1425 aa31.44■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.42■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.41■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.4■■■□□ 2.62
CTU2-201ENST00000312060 PIK3C2GO75747 1445 aa31.38■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.37■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.35■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.35■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 SLIT1O75093 1534 aa31.34■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.33■■■□□ 2.61
CTU2-201ENST00000312060 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.31■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 EID1Q9Y6B2 187 aa31.3■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.29■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 LAMC1P11047 1609 aa31.29■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 LTKP29376 864 aa31.28■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CTU2-201ENST00000312060 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.24■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 USP47Q96K76 1375 aa31.23■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 ALKQ9UM73 1620 aa31.22■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.21■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 BCANQ96GW7 911 aa31.21■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 IQGAP1P46940 1657 aa31.21■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.2■■■□□ 2.58
CTU2-201ENST00000312060 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.19■■■□□ 2.58
CTU2-201ENST00000312060 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.19■■■□□ 2.58
CTU2-201ENST00000312060 ADGRB1O14514 1584 aa31.18■■■□□ 2.58
CTU2-201ENST00000312060 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CTU2-201ENST00000312060 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CTU2-201ENST00000312060 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.12■■■□□ 2.57
CTU2-201ENST00000312060 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.11■■■□□ 2.57
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.1■■■□□ 2.57
CTU2-201ENST00000312060 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.08■■■□□ 2.57
CTU2-201ENST00000312060 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.07■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.06■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 MED14O60244 1454 aa31.05■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 METP08581 1390 aa31.04■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 TBX22Q9Y458 520 aa31.04■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.03■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 HSPA2P54652 639 aa31.03■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 STK26Q9P289 416 aa31.03■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 DIP2AQ14689 1571 aa31.03■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CTU2-201ENST00000312060 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CTU2-201ENST00000312060 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CTU2-201ENST00000312060 TESK2Q96S53 571 aa30.96■■■□□ 2.55
CTU2-201ENST00000312060 ABCC11Q96J66 1382 aa30.95■■■□□ 2.55
CTU2-201ENST00000312060 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.94■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.92■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 DLC1Q96QB1 1528 aa30.92■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 STRCQ7RTU9 1775 aa30.9■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.9■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 PIK3R4Q99570 1358 aa30.89■■■□□ 2.54
CTU2-201ENST00000312060 PTPRUQ92729 1446 aa30.89■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 SLC24A1O60721 1099 aa30.88■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 PRAM1Q96QH2 718 aa30.88■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 POGKQ9P215 609 aa30.88■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 TECPR2O15040 1411 aa30.88■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 TMF1P82094 1093 aa30.87■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.87■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 CCDC7Q96M83 1385 aa30.87■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.86■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 CPS1P31327 1500 aa30.85■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.85■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 SIRT1Q96EB6 747 aa30.85■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.83■■■□□ 2.53
CTU2-201ENST00000312060 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.82■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.82■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.81■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.8■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.79■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CTU2-201ENST00000312060 CDCA8Q53HL2 280 aa30.77■■■□□ 2.52
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