RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 KIF1BO60333 1816 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-201ENST00000311008 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 OSCARQ8IYS5 282 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 IFT172Q9UG01 1749 aa26■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 CD109Q6YHK3 1445 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 PPP2R1AP30153 589 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA6Q8N139 1617 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 PIK3C2GO75747 1445 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 MYOM1P52179 1685 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-201ENST00000311008 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRB3O60242 1522 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 MSH5O43196 834 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 ERVK-7P63135 1459 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 MROH2AA6NES4 1674 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-201ENST00000311008 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-201ENST00000311008 NPATQ14207 1427 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-201ENST00000311008 NEO1Q92859 1461 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-201ENST00000311008 NOS1P29475 1434 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS1-201ENST00000311008 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS1-201ENST00000311008 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS1-201ENST00000311008 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC3O15438 1527 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 PPLO60437 1756 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 GGT6Q6P531 493 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF521Q96K83 1311 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 NGEFQ8N5V2 710 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA2Q08379 1002 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-201ENST00000311008 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRB1O14514 1584 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 PIK3C2BO00750 1634 aa25.7■■□□□ 1.71
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.7■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 MS4A1P11836 297 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 SLFN5Q08AF3 891 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 PLIN1O60240 522 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 CRBNQ96SW2 442 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 RAPGEF3O95398 923 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS1-201ENST00000311008 USP32Q8NFA0 1604 aa25.64■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 ZFYVE9O95405 1425 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 RICTORQ6R327 1708 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 E9PSI1 815 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 APAF1O14727 1248 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 GLI2P10070 1586 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 MORC1Q86VD1 984 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 EVC2Q86UK5 1308 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-201ENST00000311008 NSD2O96028 1365 aa25.56■■□□□ 1.68
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