RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 A0A0G2JS52 829 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.28■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
KCNS1-201ENST00000306117 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.26■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 ST18O60284 1047 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 MIA2Q96PC5 1412 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 HMGXB3Q12766 1538 aa19.25■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 PHF14O94880 888 aa19.24■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 MRE11P49959 708 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 PODXL2Q9NZ53 605 aa19.23■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 ABCC5O15440 1437 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.22■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.21■□□□□ 0.67
KCNS1-201ENST00000306117 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF592Q92610 1267 aa19.2■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.2■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.2■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.19■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 LNPKQ9C0E8 428 aa19.19■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.19■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 PTPRGP23470 1445 aa19.18■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.18■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.18■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa19.18■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 TRAK2O60296 914 aa19.17■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 MLECQ14165 292 aa19.16■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.16■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.16■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 AFAP1Q8N556 730 aa19.16■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.16■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 NASPP49321 788 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 MTHFSP49914 203 aa19.14■□□□□ 0.66
KCNS1-201ENST00000306117 MAP7D2Q96T17 732 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.14■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 RNF214Q8ND24 703 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.12■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 RUNDC1Q96C34 613 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 TPM2P07951 284 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 TPM4P67936 248 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.11■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 ROCK1Q13464 1354 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 NUTM2FA1L443 756 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 MCTP1Q6DN14 999 aa19.1■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.09■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 SLFN5Q08AF3 891 aa19.08■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
KCNS1-201ENST00000306117 RIPK4P57078 832 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 ERBINQ96RT1 1412 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 HECW1Q76N89 1606 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 BECN2A8MW95 431 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 HMMRO75330 724 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.08■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.07■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 KIF16BQ96L93 1317 aa19.07■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 RRP9O43818 475 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 CABP2Q9NPB3 220 aa19.06■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 GRIN2BQ13224 1484 aa19.05■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.05■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.05■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 IGHDP01880 384 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 ESPNB1AK53 854 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 RILPL2Q969X0 211 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.04■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 HMOX1P09601 288 aa19.03■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 CREBRFQ8IUR6 639 aa19.03■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.02■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 PDE3AQ14432 1141 aa19.02■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.02■□□□□ 0.64
KCNS1-201ENST00000306117 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.02■□□□□ 0.63
KCNS1-201ENST00000306117 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
KCNS1-201ENST00000306117 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms