RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 LNPKQ9C0E8 428 aa18.46■□□□□ 0.55
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRIN2BQ13224 1484 aa18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE3AQ14432 1141 aa18.45■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 UQCRHP07919 91 aa18.43■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF214Q8ND24 703 aa18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 MCTP1Q6DN14 999 aa18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PZPP20742 1482 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.41■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLCB2Q00722 1185 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROCK1Q13464 1354 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 SSFA2P28290 1259 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.4■□□□□ 0.54
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TESK2Q96S53 571 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.39■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 WWC1Q8IX03 1113 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.38■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 MORC1Q86VD1 984 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 APBB1O00213 710 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM5CP41229 1560 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERBINQ96RT1 1412 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDCA8Q53HL2 280 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.33■□□□□ 0.53
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM177BA6PVY3 158 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSC1Q92574 1164 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 OFD1O75665 1012 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIPK4P57078 832 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.3■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF521Q96K83 1311 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 CBX1P83916 185 aa18.29■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGSF3O75054 1194 aa18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.27■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 TOPBP1Q92547 1522 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRDM2Q13029 1718 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF14Q15058 1648 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 MBD5Q9P267 1494 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYCE3A1L190 88 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP7D2Q96T17 732 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 HMGXB3Q12766 1538 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBSNQ9H1K0 784 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 RUNDC1Q96C34 613 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP53Q96M91 514 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-201ENST00000300213 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
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