RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297623.6

C9orf24-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 24, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf24, Length 1,151 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf24-201ENST00000297623 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
C9orf24-201ENST00000297623 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.71■■□□□ 1.07
C9orf24-201ENST00000297623 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.71■■□□□ 1.07
C9orf24-201ENST00000297623 ZFYVE9O95405 1425 aa21.71■■□□□ 1.07
C9orf24-201ENST00000297623 STRCQ7RTU9 1775 aa21.69■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.67■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 MED14O60244 1454 aa21.67■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 RGL3Q3MIN7 710 aa21.67■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.66■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 LTKP29376 864 aa21.65■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 STAC3Q96MF2 364 aa21.65■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 PPLO60437 1756 aa21.65■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
C9orf24-201ENST00000297623 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.63■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 IQGAP1P46940 1657 aa21.63■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.62■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 IFT172Q9UG01 1749 aa21.62■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 NEUROD1Q13562 356 aa21.61■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 MYOM2P54296 1465 aa21.59■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 BCANQ96GW7 911 aa21.59■■□□□ 1.05
C9orf24-201ENST00000297623 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.56■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 TONSLQ96HA7 1378 aa21.56■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.56■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 DIP2AQ14689 1571 aa21.55■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.53■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.52■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 TBX22Q9Y458 520 aa21.52■■□□□ 1.04
C9orf24-201ENST00000297623 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.51■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 PIK3C2GO75747 1445 aa21.51■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.51■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.5■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.5■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.5■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.49■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 PIK3R4Q99570 1358 aa21.48■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 LAMC1P11047 1609 aa21.48■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 ALKQ9UM73 1620 aa21.46■■□□□ 1.03
C9orf24-201ENST00000297623 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 KCNA6P17658 529 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
C9orf24-201ENST00000297623 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 NWD1Q149M9 1564 aa21.39■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 CPS1P31327 1500 aa21.39■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 METP08581 1390 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.34■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.33■■□□□ 1.01
C9orf24-201ENST00000297623 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.33■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 PTPRUQ92729 1446 aa21.32■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.32■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.32■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 ADGRB1O14514 1584 aa21.31■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.31■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 ABCC11Q96J66 1382 aa21.31■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 TECPR2O15040 1411 aa21.3■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 PTCH1Q13635 1447 aa21.3■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.29■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.29■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.29■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.27■■□□□ 1
C9orf24-201ENST00000297623 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.26■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.26■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 SIRT1Q96EB6 747 aa21.26■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 STK26Q9P289 416 aa21.26■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.25■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 DLC1Q96QB1 1528 aa21.25■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.25■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.24■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 TMEM94Q12767 1356 aa21.23■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 CERKQ8TCT0 537 aa21.22■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.22■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.21■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.21■□□□□ 0.99
C9orf24-201ENST00000297623 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 C14orf37Q86TY3 774 aa21.19■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 POGKQ9P215 609 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 MSH6P52701 1360 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.16■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 PRAM1Q96QH2 718 aa21.16■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.16■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 DCCP43146 1447 aa21.14■□□□□ 0.98
C9orf24-201ENST00000297623 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.14■□□□□ 0.97
C9orf24-201ENST00000297623 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms