RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297239.10

SYTL3-201, Transcript of synaptotagmin like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL3, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3-201ENST00000297239 SYNMO15061 1565 aa24.59■■□□□ 1.53
SYTL3-201ENST00000297239 NOS1P29475 1434 aa24.58■■□□□ 1.53
SYTL3-201ENST00000297239 MYOM2P54296 1465 aa24.57■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 STAC3Q96MF2 364 aa24.57■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.56■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.54■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 PIK3C2BO00750 1634 aa24.53■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 PPLO60437 1756 aa24.53■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.53■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SYTL3-201ENST00000297239 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.51■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 MRS2Q9HD23 443 aa24.5■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.48■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 REREQ9P2R6 1566 aa24.48■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 TMF1P82094 1093 aa24.47■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 IDI1Q13907 227 aa24.47■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.46■■□□□ 1.51
SYTL3-201ENST00000297239 AGLP35573 1532 aa24.45■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 MLECQ14165 292 aa24.44■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.44■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.44■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 PIK3C2GO75747 1445 aa24.43■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.41■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 PANK3Q9H999 370 aa24.39■■□□□ 1.5
SYTL3-201ENST00000297239 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.38■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.37■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 ERVK-7P63135 1459 aa24.37■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.36■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.36■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 ADGRB1O14514 1584 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.35■■□□□ 1.49
SYTL3-201ENST00000297239 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.32■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 MYOM1P52179 1685 aa24.31■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.3■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.3■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.29■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 RALBP1Q15311 655 aa24.29■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SYTL3-201ENST00000297239 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 TMC1Q8TDI8 760 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.25■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 CDCA8Q53HL2 280 aa24.24■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.24■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 ZFYVE9O95405 1425 aa24.22■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.22■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.22■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 FKBP8Q14318 412 aa24.21■■□□□ 1.47
SYTL3-201ENST00000297239 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 ZMYM3Q14202 1370 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.2■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.18■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 NLRP13Q86W25 1043 aa24.17■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 BCANQ96GW7 911 aa24.17■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.17■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.16■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 STK26Q9P289 416 aa24.15■■□□□ 1.46
SYTL3-201ENST00000297239 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 NEFLP07196 543 aa24.12■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.12■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 ALKQ9UM73 1620 aa24.11■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 SLC24A1O60721 1099 aa24.11■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.09■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.09■■□□□ 1.45
SYTL3-201ENST00000297239 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.07■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 PTPRMP28827 1452 aa24.06■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 PPP2R1AP30153 589 aa24.05■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 TNRQ92752 1358 aa24.05■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 CABP2Q9NPB3 220 aa24.03■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 PRAM1Q96QH2 718 aa24.02■■□□□ 1.44
SYTL3-201ENST00000297239 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24■■□□□ 1.43
SYTL3-201ENST00000297239 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24■■□□□ 1.43
SYTL3-201ENST00000297239 EVC2Q86UK5 1308 aa24■■□□□ 1.43
SYTL3-201ENST00000297239 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SYTL3-201ENST00000297239 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.99■■□□□ 1.43
SYTL3-201ENST00000297239 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.98■■□□□ 1.43
SYTL3-201ENST00000297239 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms