RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293068.9

IKZF3-201, Transcript of IKAROS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IKZF3, Length 2,224 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3-201ENST00000293068 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.76□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.75□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 IQGAP1P46940 1657 aa14.74□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 TESK2Q96S53 571 aa14.74□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.73□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 TMF1P82094 1093 aa14.73□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 PPLO60437 1756 aa14.72□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 IDI1Q13907 227 aa14.72□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.72□□□□□ -0.05
IKZF3-201ENST00000293068 ERVK-7P63135 1459 aa14.71□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 PIK3C2GO75747 1445 aa14.69□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 SLC24A1O60721 1099 aa14.69□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 MLECQ14165 292 aa14.69□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.69□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.68□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.67□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 CDCA8Q53HL2 280 aa14.67□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 ZFYVE9O95405 1425 aa14.66□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.66□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.65□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IKZF3-201ENST00000293068 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 ZMYM3Q14202 1370 aa14.62□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.62□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 ADGRB1O14514 1584 aa14.61□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.61□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 MRS2Q9HD23 443 aa14.61□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.6□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.6□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 RALBP1Q15311 655 aa14.6□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 CCDC184Q52MB2 194 aa14.58□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 PANK3Q9H999 370 aa14.58□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.58□□□□□ -0.07
IKZF3-201ENST00000293068 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.57□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.57□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.57□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 TNRQ92752 1358 aa14.55□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.54□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.54□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.53□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.52□□□□□ -0.08
IKZF3-201ENST00000293068 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 TMC1Q8TDI8 760 aa14.51□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.51□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 MYOM1P52179 1685 aa14.51□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 ALKQ9UM73 1620 aa14.5□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.5□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 NLRP13Q86W25 1043 aa14.49□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 NLRP1Q9C000 1473 aa14.48□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 EVC2Q86UK5 1308 aa14.47□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.47□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 STK26Q9P289 416 aa14.47□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.46□□□□□ -0.09
IKZF3-201ENST00000293068 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 PTPRMP28827 1452 aa14.45□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.45□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.44□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 C3P01024 1663 aa14.44□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 POGKQ9P215 609 aa14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 DLC1Q96QB1 1528 aa14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 PRAM1Q96QH2 718 aa14.43□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.42□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 ABCC11Q96J66 1382 aa14.41□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.41□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.41□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.4□□□□□ -0.1
IKZF3-201ENST00000293068 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.39□□□□□ -0.11
IKZF3-201ENST00000293068 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.39□□□□□ -0.11
IKZF3-201ENST00000293068 PPP2R1AP30153 589 aa14.38□□□□□ -0.11
IKZF3-201ENST00000293068 CABP2Q9NPB3 220 aa14.38□□□□□ -0.11
IKZF3-201ENST00000293068 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms