RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.49■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.49■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 SHPRHQ149N8 1683 aa16.49■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 ABCC5O15440 1437 aa16.48■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 BCANQ96GW7 911 aa16.48■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.48■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 LRP6O75581 1613 aa16.47■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
USP41-201ENST00000292729 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.45■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.45■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.45■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 TRIM52Q96A61 297 aa16.44■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 DAPK1P53355 1430 aa16.44■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 ZFYVE9O95405 1425 aa16.43■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.42■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 RXRBP28702 533 aa16.42■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.42■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.42■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 TBX22Q9Y458 520 aa16.41■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 C14orf37Q86TY3 774 aa16.4■□□□□ 0.22
USP41-201ENST00000292729 DIP2AQ14689 1571 aa16.39■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.39■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.39■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.39■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 PIK3R4Q99570 1358 aa16.38■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 ATF3P18847 181 aa16.38■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
USP41-201ENST00000292729 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.33■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 DCCP43146 1447 aa16.33■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.33■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 ADGRL2O95490 1459 aa16.33■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 TRPM2O94759 1503 aa16.32■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 AFF2P51816 1311 aa16.32■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 BRINP3Q76B58 766 aa16.32■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.31■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.31■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.29■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 APLP2Q06481 763 aa16.29■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.28■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 RGS12O14924 1447 aa16.28■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 FOXD1Q16676 465 aa16.27■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.27■□□□□ 0.2
USP41-201ENST00000292729 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 E9PCH4 1651 aa16.26■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 UNC13BO14795 1591 aa16.26■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 NGLY1Q96IV0 654 aa16.24■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 MST1RQ04912 1400 aa16.24■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 PTPRUQ92729 1446 aa16.24■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 C8orf37Q96NL8 207 aa16.23■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.22■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.22■□□□□ 0.19
USP41-201ENST00000292729 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.2■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.19■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.19■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 LAMC1P11047 1609 aa16.18■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.17■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.17■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.17■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.16■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.15■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
USP41-201ENST00000292729 CCDC125Q86Z20 511 aa16.14■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 PTCH1Q13635 1447 aa16.13■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 ADAMTS2O95450 1211 aa16.13■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 USP21Q9UK80 565 aa16.13■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.12■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.11■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 METP08581 1390 aa16.11■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 ROCK1Q13464 1354 aa16.1■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 ATRNO75882 1429 aa16.1■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 NUP155O75694 1391 aa16.09■□□□□ 0.17
USP41-201ENST00000292729 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP41-201ENST00000292729 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.05■□□□□ 0.16
USP41-201ENST00000292729 KIF1BO60333 1816 aa16.05■□□□□ 0.16
USP41-201ENST00000292729 EP400Q96L91 3159 aa16.04■□□□□ 0.16
USP41-201ENST00000292729 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP41-201ENST00000292729 ORAI2Q96SN7 254 aa16.03■□□□□ 0.16
USP41-201ENST00000292729 MYOM2P54296 1465 aa16.02■□□□□ 0.15
USP41-201ENST00000292729 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms