RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 NECTIN2Q92692 538 aa22.11■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.1■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.1■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.1■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.09■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 SEC24BO95487 1268 aa22.09■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 HMGXB3Q12766 1538 aa22.08■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 ABCC5O15440 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
NOMO3-201ENST00000263012 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.08■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 SLFN5Q08AF3 891 aa22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 RNF214Q8ND24 703 aa22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 RUNDC1Q96C34 613 aa22.07■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 KCNJ4P48050 445 aa22.06■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 MCTP1Q6DN14 999 aa22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 MAP3K1Q13233 1512 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 PANK2Q9BZ23 570 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 PTPRGP23470 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF428Q96B54 188 aa22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 MIA2Q96PC5 1412 aa22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.02■■□□□ 1.12
NOMO3-201ENST00000263012 WWC1Q8IX03 1113 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 RILPL2Q969X0 211 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.01■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 C8orf34Q49A92 452 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.99■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 MCM4P33991 863 aa21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.98■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.97■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 ERBINQ96RT1 1412 aa21.96■■□□□ 1.11
NOMO3-201ENST00000263012 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 FBLN1P23142 703 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 DRC7Q8IY82 874 aa21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 PDE3AQ14432 1141 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 A0A0G2JS52 829 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.94■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 FGD1P98174 961 aa21.93■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.92■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 MRE11P49959 708 aa21.9■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NOMO3-201ENST00000263012 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.89■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 RLBP1P12271 317 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.88■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 ST18O60284 1047 aa21.87■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 PRKAR2BP31323 418 aa21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGEF11O15085 1522 aa21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 MCCP23508 829 aa21.86■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 EVC2Q86UK5 1308 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.85■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 ESPNB1AK53 854 aa21.83■■□□□ 1.09
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.82■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 GRIN2BQ13224 1484 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 ROCK1Q13464 1354 aa21.81■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 DCTN1Q14203 1278 aa21.8■■□□□ 1.08
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