RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 PDE4AP27815 886 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRS-201ENST00000262963 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.12■□□□□ 0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.08■□□□□ 0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.01□□□□□ -0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.01□□□□□ -0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 C1orf141Q5JVX7 400 aa15□□□□□ -0.01
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PTPRS-201ENST00000262963 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 PANK1Q8TE04 598 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 ERBINQ96RT1 1412 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 KIF16BQ96L93 1317 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-201ENST00000262963 HMOX1P09601 288 aa14.96□□□□□ -0.02
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PTPRS-201ENST00000262963 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 USP35Q9P2H5 1018 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 RILPL2Q969X0 211 aa14.93□□□□□ -0.02
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PTPRS-201ENST00000262963 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.93□□□□□ -0.02
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PTPRS-201ENST00000262963 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PHF14O94880 888 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 CLSTN1O94985 981 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 GNAI1P63096 354 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 TOMM22Q9NS69 142 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 BCAR3O75815 825 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 REC8O95072 547 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 PSME1Q06323 249 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-201ENST00000262963 EVA1CP58658 441 aa14.89□□□□□ -0.03
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