RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 PRXQ9BXM0 1461 aa6.89□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.88□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 PPP2R1AP30153 589 aa6.88□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 RUNDC1Q96C34 613 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-201ENST00000261169 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.87□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-201ENST00000261169 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 WDR97A6NE52 1622 aa6.86□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.86□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 TOMM22Q9NS69 142 aa6.85□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.85□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 CABP1Q9NZU7 370 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-201ENST00000261169 USP35Q9P2H5 1018 aa6.84□□□□□ -1.31
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LMO3-201ENST00000261169 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-201ENST00000261169 DDX19BQ9UMR2 479 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-201ENST00000261169 FANCIQ9NVI1 1328 aa6.84□□□□□ -1.32
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LMO3-201ENST00000261169 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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LMO3-201ENST00000261169 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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LMO3-201ENST00000261169 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.81□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 FOSBP53539 338 aa6.81□□□□□ -1.32
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LMO3-201ENST00000261169 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.8□□□□□ -1.32
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LMO3-201ENST00000261169 DCTN1Q14203 1278 aa6.8□□□□□ -1.32
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LMO3-201ENST00000261169 GPATCH3Q96I76 525 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 CFAP44Q96MT7 982 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 CDK19Q9BWU1 502 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.8□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 KIF16BQ96L93 1317 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 FAM177BA6PVY3 158 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 MCTP1Q6DN14 999 aa6.79□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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