RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.12■■□□□ 1.93
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DUSP1-201ENST00000239223 TNRQ92752 1358 aa27.08■■□□□ 1.93
DUSP1-201ENST00000239223 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
DUSP1-201ENST00000239223 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.08■■□□□ 1.93
DUSP1-201ENST00000239223 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.05■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.05■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 STAC3Q96MF2 364 aa27.05■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.04■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 LAMC1P11047 1609 aa27.04■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.04■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.02■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 PIK3C2GO75747 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.02■■□□□ 1.92
DUSP1-201ENST00000239223 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.99■■□□□ 1.91
DUSP1-201ENST00000239223 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.99■■□□□ 1.91
DUSP1-201ENST00000239223 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.98■■□□□ 1.91
DUSP1-201ENST00000239223 IQGAP1P46940 1657 aa26.97■■□□□ 1.91
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DUSP1-201ENST00000239223 ZFYVE9O95405 1425 aa26.93■■□□□ 1.9
DUSP1-201ENST00000239223 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.92■■□□□ 1.9
DUSP1-201ENST00000239223 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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DUSP1-201ENST00000239223 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.9■■□□□ 1.9
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DUSP1-201ENST00000239223 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.87■■□□□ 1.89
DUSP1-201ENST00000239223 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.86■■□□□ 1.89
DUSP1-201ENST00000239223 TESK2Q96S53 571 aa26.85■■□□□ 1.89
DUSP1-201ENST00000239223 MIER1Q8N108 512 aa26.83■■□□□ 1.89
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.83■■□□□ 1.89
DUSP1-201ENST00000239223 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.81■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 ALKQ9UM73 1620 aa26.81■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.8■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 PTPRMP28827 1452 aa26.79■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.79■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.78■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 LTKP29376 864 aa26.77■■□□□ 1.88
DUSP1-201ENST00000239223 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
DUSP1-201ENST00000239223 SLIT1O75093 1534 aa26.73■■□□□ 1.87
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.73■■□□□ 1.87
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DUSP1-201ENST00000239223 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
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DUSP1-201ENST00000239223 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.64■■□□□ 1.86
DUSP1-201ENST00000239223 EID1Q9Y6B2 187 aa26.62■■□□□ 1.85
DUSP1-201ENST00000239223 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.61■■□□□ 1.85
DUSP1-201ENST00000239223 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
DUSP1-201ENST00000239223 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.59■■□□□ 1.85
DUSP1-201ENST00000239223 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.59■■□□□ 1.85
DUSP1-201ENST00000239223 MED14O60244 1454 aa26.57■■□□□ 1.84
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DUSP1-201ENST00000239223 MYOM1P52179 1685 aa26.55■■□□□ 1.84
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DUSP1-201ENST00000239223 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.54■■□□□ 1.84
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DUSP1-201ENST00000239223 ABCC11Q96J66 1382 aa26.51■■□□□ 1.83
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DUSP1-201ENST00000239223 CDCA8Q53HL2 280 aa26.46■■□□□ 1.83
DUSP1-201ENST00000239223 CPS1P31327 1500 aa26.46■■□□□ 1.83
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DUSP1-201ENST00000239223 PANK3Q9H999 370 aa26.46■■□□□ 1.83
DUSP1-201ENST00000239223 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.45■■□□□ 1.82
DUSP1-201ENST00000239223 TBX22Q9Y458 520 aa26.44■■□□□ 1.82
DUSP1-201ENST00000239223 DIP2AQ14689 1571 aa26.44■■□□□ 1.82
DUSP1-201ENST00000239223 SLC24A1O60721 1099 aa26.42■■□□□ 1.82
DUSP1-201ENST00000239223 CABP2Q9NPB3 220 aa26.42■■□□□ 1.82
DUSP1-201ENST00000239223 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
DUSP1-201ENST00000239223 EVC2Q86UK5 1308 aa26.41■■□□□ 1.82
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