RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.94■■□□□ 1.42
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PANX1-201ENST00000227638 PDE3BQ13370 1112 aa23.93■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 ATP7AQ04656 1500 aa23.93■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.93■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 SLC4A3P48751 1232 aa23.92■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.91■■□□□ 1.42
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PANX1-201ENST00000227638 ERVK-7P63135 1459 aa23.66■■□□□ 1.38
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PANX1-201ENST00000227638 NOS1P29475 1434 aa23.65■■□□□ 1.38
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PANX1-201ENST00000227638 ABCA6Q8N139 1617 aa23.63■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 NPATQ14207 1427 aa23.62■■□□□ 1.37
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PANX1-201ENST00000227638 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.6■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 C8orf34Q49A92 452 aa23.6■■□□□ 1.37
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PANX1-201ENST00000227638 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.58■■□□□ 1.37
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PANX1-201ENST00000227638 PIK3C2GO75747 1445 aa23.57■■□□□ 1.36
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PANX1-201ENST00000227638 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.55■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 SEC24BO95487 1268 aa23.53■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 E9PSI1 815 aa23.53■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 RLBP1P12271 317 aa23.53■■□□□ 1.36
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