RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 CCDC184Q52MB2 194 aa25.07■■□□□ 1.6
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USP18-201ENST00000215794 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.06■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.05■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 IDI1Q13907 227 aa25.04■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 MROH2AA6NES4 1674 aa25.04■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
USP18-201ENST00000215794 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.03■■□□□ 1.6
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USP18-201ENST00000215794 KIF1BO60333 1816 aa25■■□□□ 1.59
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USP18-201ENST00000215794 LAMC1P11047 1609 aa24.88■■□□□ 1.57
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USP18-201ENST00000215794 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.88■■□□□ 1.57
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USP18-201ENST00000215794 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.82■■□□□ 1.56
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USP18-201ENST00000215794 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.79■■□□□ 1.56
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USP18-201ENST00000215794 BCANQ96GW7 911 aa24.76■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 MYOM2P54296 1465 aa24.72■■□□□ 1.55
USP18-201ENST00000215794 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
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USP18-201ENST00000215794 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.71■■□□□ 1.55
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USP18-201ENST00000215794 ZFYVE9O95405 1425 aa24.68■■□□□ 1.54
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USP18-201ENST00000215794 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.68■■□□□ 1.54
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USP18-201ENST00000215794 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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USP18-201ENST00000215794 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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USP18-201ENST00000215794 TMC1Q8TDI8 760 aa24.61■■□□□ 1.53
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USP18-201ENST00000215794 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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USP18-201ENST00000215794 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.53■■□□□ 1.52
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USP18-201ENST00000215794 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.49■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 NLRP13Q86W25 1043 aa24.49■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.48■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 METP08581 1390 aa24.47■■□□□ 1.51
USP18-201ENST00000215794 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.47■■□□□ 1.51
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