RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.36■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.35■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.34■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TMED1-201ENST00000214869 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TMED1-201ENST00000214869 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TMED1-201ENST00000214869 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.3■■□□□ 1.16
TMED1-201ENST00000214869 PIK3C2GO75747 1445 aa22.28■■□□□ 1.16
TMED1-201ENST00000214869 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.28■■□□□ 1.16
TMED1-201ENST00000214869 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TMED1-201ENST00000214869 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.26■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 PTPRMP28827 1452 aa22.25■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.25■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.24■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 IQGAP1P46940 1657 aa22.23■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.22■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.22■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 USP47Q96K76 1375 aa22.21■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.21■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.21■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 SLIT1O75093 1534 aa22.2■■□□□ 1.15
TMED1-201ENST00000214869 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 ADGRB1O14514 1584 aa22.17■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.16■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TMED1-201ENST00000214869 ALKQ9UM73 1620 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.13■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.11■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED1-201ENST00000214869 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 EID1Q9Y6B2 187 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 LTKP29376 864 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 MED14O60244 1454 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 TESK2Q96S53 571 aa22.03■■□□□ 1.12
TMED1-201ENST00000214869 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.02■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 DIP2AQ14689 1571 aa22.01■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 CCDC7Q96M83 1385 aa22.01■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.01■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 SLC24A1O60721 1099 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 DLC1Q96QB1 1528 aa21.99■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.97■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.96■■□□□ 1.11
TMED1-201ENST00000214869 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.95■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 ABCC11Q96J66 1382 aa21.95■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.95■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 TBX22Q9Y458 520 aa21.95■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 TECPR2O15040 1411 aa21.95■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 METP08581 1390 aa21.93■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.93■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 TMF1P82094 1093 aa21.91■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 SIRT1Q96EB6 747 aa21.91■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 CPS1P31327 1500 aa21.91■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 PIK3R4Q99570 1358 aa21.9■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.9■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TMED1-201ENST00000214869 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.89■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 BCANQ96GW7 911 aa21.87■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 CDCA8Q53HL2 280 aa21.86■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 STK26Q9P289 416 aa21.86■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 HSPA2P54652 639 aa21.85■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.84■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 PTPRUQ92729 1446 aa21.83■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TMED1-201ENST00000214869 PRAM1Q96QH2 718 aa21.81■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.81■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 PTCH1Q13635 1447 aa21.81■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 MYOM1P52179 1685 aa21.8■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 POGKQ9P215 609 aa21.8■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.8 ms