RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 IDI1Q13907 227 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 ERVK-7P63135 1459 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC25A3-201ENST00000188376 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC25A3-201ENST00000188376 IQGAP1P46940 1657 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A3-201ENST00000188376 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A3-201ENST00000188376 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC25A3-201ENST00000188376 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC25A3-201ENST00000188376 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 TESK2Q96S53 571 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 PIK3C2GO75747 1445 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 ZMYM3Q14202 1370 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 CCER2I3L3R5 266 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC25A3-201ENST00000188376 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 TMF1P82094 1093 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC25A3-201ENST00000188376 ZFYVE9O95405 1425 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC25A3-201ENST00000188376 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRB1O14514 1584 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC25A3-201ENST00000188376 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC25A3-201ENST00000188376 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TNRQ92752 1358 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC25A3-201ENST00000188376 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC25A3-201ENST00000188376 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC25A3-201ENST00000188376 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.48■■□□□ 1.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SLC25A3-201ENST00000188376 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 CDCA8Q53HL2 280 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 C3P01024 1663 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC24A1O60721 1099 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 ALKQ9UM73 1620 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC184Q52MB2 194 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 PANK3Q9H999 370 aa26.39■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.38■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 MYOM1P52179 1685 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 STK26Q9P289 416 aa26.35■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 NLRP1Q9C000 1473 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 MRS2Q9HD23 443 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC25A3-201ENST00000188376 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPRMP28827 1452 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 RALBP1Q15311 655 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SLC25A3-201ENST00000188376 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 PRAM1Q96QH2 718 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 BCANQ96GW7 911 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 EVC2Q86UK5 1308 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 POGKQ9P215 609 aa26.2■■□□□ 1.79
SLC25A3-201ENST00000188376 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 LTKP29376 864 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 METP08581 1390 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 TMC1Q8TDI8 760 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 DLC1Q96QB1 1528 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 SLIT1O75093 1534 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A3-201ENST00000188376 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC11Q96J66 1382 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 CABP2Q9NPB3 220 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 EID1Q9Y6B2 187 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms