RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.62■■□□□ 1.69
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SIKE1-201ENST00000060969 PIK3C2BO00750 1634 aa25.6■■□□□ 1.69
SIKE1-201ENST00000060969 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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SIKE1-201ENST00000060969 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.58■■□□□ 1.69
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SIKE1-201ENST00000060969 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.55■■□□□ 1.68
SIKE1-201ENST00000060969 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
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SIKE1-201ENST00000060969 IDI1Q13907 227 aa25.53■■□□□ 1.68
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.52■■□□□ 1.68
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SIKE1-201ENST00000060969 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SIKE1-201ENST00000060969 PIK3C2GO75747 1445 aa25.5■■□□□ 1.67
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SIKE1-201ENST00000060969 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.47■■□□□ 1.67
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SIKE1-201ENST00000060969 PANK3Q9H999 370 aa25.44■■□□□ 1.66
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SIKE1-201ENST00000060969 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.41■■□□□ 1.66
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SIKE1-201ENST00000060969 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.38■■□□□ 1.65
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SIKE1-201ENST00000060969 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SIKE1-201ENST00000060969 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SIKE1-201ENST00000060969 CDCA8Q53HL2 280 aa25.34■■□□□ 1.65
SIKE1-201ENST00000060969 TMC1Q8TDI8 760 aa25.32■■□□□ 1.64
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.32■■□□□ 1.64
SIKE1-201ENST00000060969 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SIKE1-201ENST00000060969 ZFYVE9O95405 1425 aa25.3■■□□□ 1.64
SIKE1-201ENST00000060969 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.29■■□□□ 1.64
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SIKE1-201ENST00000060969 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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SIKE1-201ENST00000060969 NLRP13Q86W25 1043 aa25.24■■□□□ 1.63
SIKE1-201ENST00000060969 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.23■■□□□ 1.63
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SIKE1-201ENST00000060969 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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SIKE1-201ENST00000060969 SLC24A1O60721 1099 aa25.21■■□□□ 1.63
SIKE1-201ENST00000060969 MYT1Q01538 1121 aa25.21■■□□□ 1.63
SIKE1-201ENST00000060969 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SIKE1-201ENST00000060969 STK26Q9P289 416 aa25.2■■□□□ 1.62
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SIKE1-201ENST00000060969 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.13■■□□□ 1.61
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SIKE1-201ENST00000060969 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SIKE1-201ENST00000060969 TNRQ92752 1358 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-201ENST00000060969 PTPRMP28827 1452 aa25.11■■□□□ 1.61
SIKE1-201ENST00000060969 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-201ENST00000060969 NEFLP07196 543 aa25.1■■□□□ 1.61
SIKE1-201ENST00000060969 PPP2R1AP30153 589 aa25.09■■□□□ 1.61
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SIKE1-201ENST00000060969 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 EVC2Q86UK5 1308 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 PRAM1Q96QH2 718 aa25.07■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 CABP2Q9NPB3 220 aa25.05■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.04■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 BCANQ96GW7 911 aa25.04■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.03■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.03■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.02■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 POGKQ9P215 609 aa25.02■■□□□ 1.6
SIKE1-201ENST00000060969 C3P01024 1663 aa24.98■■□□□ 1.59
SIKE1-201ENST00000060969 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.98■■□□□ 1.59
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