RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TBX21Q9UL17 535 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MAPK13O15264 365 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ACTN1P12814 892 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ARID5AQ03989 594 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 NAB2Q15742 525 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 MAP9Q49MG5 647 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.45■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CYP2C18P33260 490 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CCL23P55773 120 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TMEM192Q8IY95 271 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 SCLYQ96I15 445 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.44■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 A0A087X0T9 212 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 NBNO60934 754 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 FAM228BP0C875 321 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 KRT13P13646 458 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 C2orf54Q08AI8 447 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 BFSP1Q12934 665 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 GPNMBQ14956 572 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 UBXN11Q5T124 520 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CHST12Q9NRB3 414 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 BUB1O43683 1085 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 STAG3L1P0CL83 205 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ANXA13P27216 316 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 DLG4P78352 724 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CYP24A1Q07973 514 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 COG1Q8WTW3 980 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.43■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 VAMP7P51809 220 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CASP8Q14790 479 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 RUBCNQ92622 972 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ABHD8Q96I13 439 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TLR10Q9BXR5 811 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 GCNT4Q9P109 453 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.42■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 MGEA5O60502 916 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TRIM49P0CI25 452 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TRIM49CP0CI26 452 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PRKCIP41743 596 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 WNT7BP56706 349 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PTK2Q05397 1052 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CCDC181Q5TID7 509 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 SIX2Q9NPC8 291 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 HES2Q9Y543 173 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 NCK2O43639 380 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CLTAP09496 248 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PAFAH1B1P43034 410 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 FAM212AQ96EL1 285 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 SNTG2Q9NY99 539 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.41■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 GRM5P41594 1212 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 JAM2P57087 298 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 DSC3Q14574 896 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ADAM2Q99965 735 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 RNF14Q9UBS8 474 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.4■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PALMO75781 387 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 CXCL8P10145 99 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ITGB8P26012 769 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PSMD6Q15008 389 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 KYAT1Q16773 422 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.39■■□□□ 1.02
CLN8-208ENST00000635751 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms