RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	PTPA	Q15257	358 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	SPECC1	Q5M775	1068 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ITFG1	Q8TB96	612 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	DDX12P	Q92771	950 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TBC1D4	O60343	1298 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ATF2	P15336	505 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TPGS2	Q68CL5	300 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	GPR152	Q8TDT2	470 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	NOTCH4	Q99466	2003 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	LACTBL1	A8MY62	500 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	RHO	P08100	348 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	GTF2B	Q00403	316 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	PARM1	Q6UWI2	310 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	FGF14	Q92915	247 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	FAM212A	Q96EL1	285 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568		A0A0B4J269	797 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	KRBA1	A5PL33	1030 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	FAM189A1	O60320	539 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CPB1	P15086	417 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	USP49	Q70CQ1	688 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CD302	Q8IX05	232 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ING5	Q8WYH8	240 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	FIZ1	Q96SL8	496 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	BACH2	Q9BYV9	841 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	PTPN2	P17706	415 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ZBTB6	Q15916	424 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	DYM	Q7RTS9	669 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ELMOD1	Q8N336	334 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	BEST2	Q8NFU1	509 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568		M0QZQ0	153 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	PI15	O43692	258 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	USP37	Q86T82	979 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SFR1	Q86XK3	245 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CLIC6	Q96NY7	704 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	MAFF	Q9ULX9	164 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ADCY1	Q08828	1119 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ADAL	Q6DHV7	355 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	HVCN1	Q96D96	273 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CORO1B	Q9BR76	489 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	GDE1	Q9NZC3	331 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	MTMR6	Q9Y217	621 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SEC24A	O95486	1093 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ADRB2	P07550	413 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	GUCY2F	P51841	1108 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	SPATA1	Q5VX52	437 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	JADE1	Q6IE81	842 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	IQCE	Q6IPM2	695 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TCF4-259	ENST00000627568	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF197	O14709	1029 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	STX6	O43752	255 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	GAP43	P17677	238 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	GPC5	P78333	572 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TCF4-259	ENST00000627568	SHD	Q96IW2	340 aa		27.82	■■■□□ 2.04

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