RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613575.4

CDKAL1-204, Transcript of CDK5 regulatory subunit associated protein 1 like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDKAL1, Length 1,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKAL1-204ENST00000613575 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 USP3Q9Y6I4 520 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SQORQ9Y6N5 450 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SCINQ9Y6U3 715 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.13□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 F5H6K3 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 F8W031 263 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ZNF263O14978 683 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PRMT3O60678 531 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 NFKBIAP25963 317 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SLC16A2P36021 539 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SLC1A4P43007 532 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 TNNI2P48788 182 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PEX5P50542 639 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 VAV2P52735 878 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SLC12A3P55017 1021 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 DR1Q01658 176 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 RASSF7Q02833 373 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KLRC3Q07444 240 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KCNMA1Q12791 1236 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 UBE2SQ16763 222 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 C4orf17Q53FE4 359 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KCTD1Q719H9 257 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 C8orf48Q96LL4 319 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 TSG101Q99816 390 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 AMNQ9BXJ7 453 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PANK4Q9NVE7 773 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KLF15Q9UIH9 416 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 CFAP73A6NFT4 308 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 TACC1O75410 805 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 MMP10P09238 476 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PLA2G4BP0C869 781 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 RPA1P27694 616 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SREBF1P36956 1147 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PIK3CAP42336 1068 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KLK7P49862 253 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PDE6CP51160 858 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 FOXK2Q01167 660 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 COASYQ13057 564 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SEPT6Q14141 434 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ARSHQ5FYA8 562 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 KLC3Q6P597 504 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 DYMQ7RTS9 669 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SPERTQ8NA61 448 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 LENG9Q96B70 501 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 CDHR1Q96JP9 859 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 CCDC42Q96M95 316 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 SH3GL2Q99962 352 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ANO3Q9BYT9 981 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 MUC3BQ9H195 1237 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 EPN3Q9H201 632 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 CARD9Q9H257 536 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.12□□□□□ -1.27
CDKAL1-204ENST00000613575 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms