RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612199.4

SRGAP2B-204, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRGAP2B, Length 7,120 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2B-204ENST00000612199 VCAM1P19320 739 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 APPL1Q9UKG1 709 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TLK1Q9UKI8 766 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 AK9Q5TCS8 1911 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRPA1O75762 1119 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 KRT37O76014 449 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CIITAP33076 1130 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 NR1H3Q13133 447 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 RCN2Q14257 317 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PACS2Q86VP3 889 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CENPKQ9BS16 269 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.96□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PDXKO00764 312 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 STX1BP61266 288 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ICE2Q659A1 982 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 WDR24Q96S15 920 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 A0A1B0GTH6 734 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MMP19Q99542 508 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 USE1Q9NZ43 259 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 KLHL3Q9UH77 587 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PLAAQ9Y263 795 aa9.96□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 CALB1P05937 261 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 TTLL4Q14679 1199 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PCGF5Q86SE9 256 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM143Q96AN5 459 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PFASO15067 1338 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MYMKA6NI61 221 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 E2F6O75461 281 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ITGAXP20702 1163 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 GRK2P25098 689 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 EPHA7Q15375 998 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ADSSL1Q8N142 457 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 EGFL8Q99944 293 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 FBXO10Q9UK96 956 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 REREQ9P2R6 1566 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ERVK-10P10266 1014 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PLCL1Q15111 1095 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 REEP2Q9BRK0 252 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 EPN3Q9H201 632 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 GINM1Q9NU53 330 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 CPB1P15086 417 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PHKA2P46019 1235 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 SEMA3AQ14563 771 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 CCDC142Q17RM4 750 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PDXDC1Q6P996 788 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 RNF149Q8NC42 400 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MEGF6O75095 1541 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 CHRNA3P32297 505 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACOT2P49753 483 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 NFIAQ12857 509 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 KRT78Q8N1N4 520 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 NKD1Q969G9 470 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 NUP85Q9BW27 656 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 GOLGA8RI6L899 631 aa9.95□□□□□ -0.82
SRGAP2B-204ENST00000612199 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms