RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 M0R082 166 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 TGM5O43548 720 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ITGA4P13612 1032 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 MLH1P40692 756 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 STARD6P59095 220 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 GPC5P78333 572 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 DSG1Q02413 1049 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 Q4G0T1 1027 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 LILRA6Q6PI73 481 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 BRF1Q92994 677 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 TMEM143Q96AN5 459 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 GAD1Q99259 594 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SLC30A3Q99726 388 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PIDD1Q9HB75 910 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CHST7Q9NS84 486 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 HES2Q9Y543 173 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 IPPQ9Y573 584 aa9.77□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 FRYLO94915 3013 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ARL5CA6NH57 179 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CYP3A7P24462 503 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ATP1A2P50993 1020 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SCNN1GP51170 649 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PSMC5P62195 406 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 NTHL1P78549 312 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 FGD1P98174 961 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 FUT10Q6P4F1 479 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PARM1Q6UWI2 310 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 Q6ZUG5 572 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SKAP1Q86WV1 359 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 RABGGTAQ92696 567 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 FGF14Q92915 247 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 MBOAT7Q96N66 472 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 DPP7Q9UHL4 492 aa9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 M0R2N6 131 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SLC37A4O43826 429 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 TSPAN1O60635 241 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 KINO60870 393 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 NLRP5P59047 1200 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SPEM2Q0P670 501 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 KRT32Q14532 448 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 NPY5RQ15761 445 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 RNF149Q8NC42 400 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CPB2Q96IY4 423 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CEP170P1Q96L14 293 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 NACC1Q96RE7 527 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 APOL6Q9BWW8 343 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 FNIP2Q9P278 1114 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 VAV3Q9UKW4 847 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.75□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.74□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 ERLIN2O94905 339 aa9.74□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 C1RP00736 705 aa9.74□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 IFNAR1P17181 557 aa9.74□□□□□ -0.85
TTR-204ENST00000610404 CD72P21854 359 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms