RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601665.5

NUP62-223, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 5

Gene NUP62, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-223	ENST00000601665	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	LYPLA2	O95372	231 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SEC24A	O95486	1093 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	XBP1	P17861	261 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CTH	P32929	405 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	MPL	P40238	635 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	RARRES1	P49788	294 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TWF1	Q12792	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PON2	Q15165	354 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TEAD2	Q15562	447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	FZD8	Q9H461	694 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ARNTL	O00327	626 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SYN3	O14994	580 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CPB1	P15086	417 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PSMA5	P28066	241 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ELF2	Q15723	593 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SPEG	Q15772	3267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	COL4A2	P08572	1712 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ACKR2	O00590	384 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PODXL	O00592	558 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	EXTL3	O43909	919 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ATG13	O75143	517 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PLD1	Q13393	1074 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	NPY5R	Q15761	445 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CEP72	Q9P209	647 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665		A0A087WWV3	80 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665		A0A1W2PRU2	124 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	MOSPD3	O75425	235 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	AKAP3	O75969	853 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SPINK2	P20155	84 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	EPHA5	P54756	1037 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CREB5	Q02930	508 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CCIN	Q13939	588 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PTPA	Q15257	358 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CALCRL	Q16602	461 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NUP62-223	ENST00000601665	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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