RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589211.1

EFTUD2-212, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-212ENST00000589211 WASF1Q92558 559 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 C1orf159Q96HA4 380 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-212ENST00000589211 GBF1Q92538 1859 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 VSTM5A8MXK1 200 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ADAMTS3O15072 1205 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 F2P00734 622 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ALBP02768 609 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ZNF286BP0CG31 522 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 HOXC12P31275 282 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 MAP2K3P46734 347 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 KCNJ6P48051 423 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 GPNMBQ14956 572 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 UBE2SQ16763 222 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TMEM199Q8N511 208 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 GTF3C6Q969F1 213 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 IL23AQ9NPF7 189 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CDH23Q9H251 3354 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 HAS3O00219 553 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CBX4O00257 560 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 AQP7O14520 342 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ST8SIA5O15466 376 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SH3BP5O60239 455 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 PFKFB2O60825 505 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 PPFIA3O75145 1194 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 GGPS1O95749 300 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SCG5P05408 212 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CCND2P30279 289 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 DGKGP49619 791 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ZNF445P59923 1031 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 PPTC7Q8NI37 304 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TMX3Q96JJ7 454 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 AAASQ9NRG9 546 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 EYSQ5T1H1 3165 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TET1Q8NFU7 2136 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 LILRB5O75023 590 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ATP9AO75110 1047 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ITGB5P18084 799 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ICAM3P32942 547 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 IL2P60568 153 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 DSG1Q02413 1049 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CUL4AQ13619 759 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 DGKDQ16760 1214 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TCTN1Q2MV58 587 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 USP53Q70EK8 1073 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SESTD1Q86VW0 696 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 TPH2Q8IWU9 490 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 NXPE1Q8N323 547 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 HERVK_113Q902F9 699 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-212ENST00000589211 SPATA33Q96N06 139 aa9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms