RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 EIF6P56537 245 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TUBA1BP68363 451 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ITIH3Q06033 890 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SP140Q13342 867 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 LSAMPQ13449 338 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 BECN1Q14457 450 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 COG2Q14746 738 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD6Q15008 389 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 IQCB1Q15051 598 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TESK1Q15569 626 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ELF2Q15723 593 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PROSER3Q2NL68 480 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MUM1L1Q5H9M0 696 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP15Q5T1M5 1219 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NXNQ6DKJ4 435 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TUBA1AQ71U36 451 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC186Q7Z3E2 898 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 IQCA1Q86XH1 822 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PROSER1Q86XN7 944 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TEX11Q8IYF3 940 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 VPS52Q8N1B4 723 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 USP38Q8NB14 1042 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NAXEQ8NCW5 288 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC148Q8NFR7 591 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PJA1Q8NG27 643 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL11Q8NHH1 800 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 APEX2Q9UBZ4 518 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ITIH6Q6UXX5 1313 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 EEA1Q15075 1411 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 E2F8A0AVK6 867 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 VSTM5A8MXK1 200 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB14O43829 449 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CEP104O60308 925 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RAMP2O60895 175 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF254O75437 659 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 ATP5DP30049 168 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CD86P42081 329 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 EPS15P42566 896 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 ASMTP46597 345 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 GIPRP48546 466 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 GUCY2FP51841 1108 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MNAT1P51948 309 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ADCY1Q08828 1119 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA3AQ14563 771 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CSRP2Q16527 193 aa3.36□□□□□ -1.87
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