RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	SCP2	P22307	547 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TXLNA	P40222	546 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	EPSTI1	Q96J88	318 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CORO1B	Q9BR76	489 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP4C-208	ENST00000564966	LACTBL1	A8MY62	500 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPN2	P17706	415 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF131	P52739	623 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	DYM	Q7RTS9	669 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	USP37	Q86T82	979 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ELMOD1	Q8N336	334 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	KXD1	Q9BQD3	176 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC26	A0AVF1	554 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ABLIM3	O94929	683 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ATF2	P15336	505 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCD1	P33897	745 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	DDIT3	P35638	169 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	GUCY2F	P51841	1108 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	GPC5	P78333	572 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CACNA1H	O95180	2353 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SEC24A	O95486	1093 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SYT1	P21579	422 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCY1	Q08828	1119 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	TPGS2	Q68CL5	300 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	USP49	Q70CQ1	688 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP3A5	P20815	502 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAL	Q6DHV7	355 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	IQCE	Q6IPM2	695 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	BEST2	Q8NFU1	509 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CLIC6	Q96NY7	704 aa		27.54	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D4	O60343	1298 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	PIGR	P01833	764 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	LRPAP1	P30533	357 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	REST	Q13127	1097 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPA	Q15257	358 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ANGPT1	Q15389	498 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	JADE1	Q6IE81	842 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SHD	Q96IW2	340 aa		27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0B4J269	797 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CEBPB	P17676	345 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	GTF2B	Q00403	316 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	TWF1	Q12792	350 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SFR1	Q86XK3	245 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	STK17A	Q9UEE5	414 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
PPP4C-208	ENST00000564966	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966		M0QZQ0	153 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	ACOT2	P49753	483 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB6	Q15916	424 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	SV2B	Q7L1I2	683 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	CD302	Q8IX05	232 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNN1	Q92952	543 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	GDE1	Q9NZC3	331 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	TISP43	B9A030	160 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF197	O14709	1029 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM189A1	O60320	539 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	OR4Q2	P0C623	313 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	MYL4	P12829	197 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PPP4C-208	ENST00000564966	PFKP	Q01813	784 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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