RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, human

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4B-204	ENST00000558065	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SCO2	O43819	266 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	COBL	O75128	1261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	STAT2	P52630	851 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ITM2A	O43736	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	DCTN3	O75935	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	USP1	O94782	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	KRT6C	P48668	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	TNNI2	P48788	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PEX3	P56589	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	GRIN1	Q05586	938 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	BTK	Q06187	659 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MOGS	Q13724	837 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PLK2	Q9NYY3	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	BTD	P43251	543 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SLC5A3	P53794	718 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	UBXN1	Q04323	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	FOLH1	Q04609	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	APOF	Q13790	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	KRT32	Q14532	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	COL15A1	P39059	1388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065		B8ZZF3	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ALX3	O95076	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	GH1	P01241	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	INHBB	P09529	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NR4A1	P22736	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	BMPR1A	P36894	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	HPS1	Q92902	700 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	EMSY	Q7Z589	1322 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	GAS8	O95995	478 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	GSTM1	P09488	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	CREB1	P16220	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MOG	Q16653	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	G2E3	Q7L622	706 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	ESR2	Q92731	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	COQ7	Q99807	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065		A8MXQ7	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SEMA4B-204	ENST00000558065	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms