RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 NOMO3P69849 1222 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 LONRF1Q17RB8 773 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.59■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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TMEM260-216ENST00000557657 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.59■■□□□ 1.21
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TMEM260-216ENST00000557657 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM260-216ENST00000557657 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM260-216ENST00000557657 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.57■■□□□ 1.2
TMEM260-216ENST00000557657 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.57■■□□□ 1.2
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TMEM260-216ENST00000557657 OSTNP61366 133 aa22.56■■□□□ 1.2
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TMEM260-216ENST00000557657 WEE2P0C1S8 567 aa22.54■■□□□ 1.2
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TMEM260-216ENST00000557657 LBX2Q6XYB7 198 aa22.54■■□□□ 1.2
TMEM260-216ENST00000557657 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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TMEM260-216ENST00000557657 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TMEM260-216ENST00000557657 CENPFP49454 3210 aa22.54■■□□□ 1.2
TMEM260-216ENST00000557657 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.53■■□□□ 1.2
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TMEM260-216ENST00000557657 ADCY8P40145 1251 aa22.53■■□□□ 1.2
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