RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 IQCEQ6IPM2 695 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 BEST2Q8NFU1 509 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 BAP1Q92560 729 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TOP1MTQ969P6 601 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 ARID3AQ99856 593 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 POLIQ9UNA4 740 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-216ENST00000549221 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ZBBXA8MT70 800 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PIRO00625 290 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PHACTR2O75167 634 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 DGKIO75912 1065 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 BAIAP3O94812 1187 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 FGBP02675 491 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ITGB1P05556 798 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TPM3P06753 285 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 THP07101 528 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 KRT19P08727 400 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 UCHL3P15374 230 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 LRPAP1P30533 357 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 CLCNKBP51801 687 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 AP3M2P53677 418 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 RRAGAQ7L523 313 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 HERVK_113Q902F9 699 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 GPR88Q9GZN0 384 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 SDCBP2Q9H190 292 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PODXLO00592 558 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 AMHP03971 560 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 CYP3A5P20815 502 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 CASP14P31944 242 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PBX3P40426 434 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ASPAP45381 313 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 RBP5P82980 135 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TUSC3Q13454 348 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TRPC3Q13507 836 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 UPP1Q16831 310 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ZNF699Q32M78 642 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 FIGNQ5HY92 759 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 RASIP1Q5U651 963 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 NEK11Q8NG66 645 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 URGCPQ8TCY9 931 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 HASPINQ8TF76 798 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 HPDLQ96IR7 371 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 EYSQ5T1H1 3165 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 LCHNA4D1U4 455 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 H0YGN5 161 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 I3L4J1 428 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 HOXA2O43364 376 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 HCRTO43612 131 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 EFCAB14O75071 495 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 MFAP3LO75121 409 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-216ENST00000549221 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms