RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CCR2P41597 374 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 FZD5Q13467 585 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TPGS2Q68CL5 300 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 RINT1Q6NUQ1 792 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZBTB44Q8NCP5 570 aa18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.58■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 TWF1Q12792 350 aa18.57■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 ZNF280DQ6N043 979 aa18.57■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 SUSD3Q96L08 255 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.57■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.57■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.57■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 CITO14578 2027 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SHISA7A6NL88 538 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ABLIM1O14639 778 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 LILRB5O75023 590 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SEC24BO95487 1268 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MYL4P12829 197 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 CPB1P15086 417 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PSMC3P17980 439 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 GDI1P31150 447 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MAPK7Q13164 816 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SMARCD2Q92925 531 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 CEP72Q9P209 647 aa18.56■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TOM1L1O75674 476 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 GJA1P17302 382 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 VITQ6UXI7 678 aa18.55■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 KCNK18Q7Z418 384 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 FAM3CQ92520 227 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 NELL1Q92832 810 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 EPC1Q9H2F5 836 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ASAH2Q9NR71 780 aa18.55■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MAFFQ9ULX9 164 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.55■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 LAD1O00515 517 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZNF263O14978 683 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 MOSPD3O75425 235 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.564e-10■■□□□ 11.6
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CS-214ENST00000548849 SMTNP53814 917 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 LEMD2Q8NC56 503 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TIPINQ9BVW5 301 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.54■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.54■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 CLDN3O15551 220 aa18.53■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 GUCY2CP25092 1073 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 NRLP54845 237 aa18.53■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 PPP2R5DQ14738 602 aa18.53■□□□□ 0.56
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CS-214ENST00000548849 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.53■□□□□ 0.56
CS-214ENST00000548849 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.53■□□□□ 0.56
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