RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 CLCNKBP51801 687 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 ELMOD1Q8N336 334 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 HHIPQ96QV1 700 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.99■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 RHOBTB1O94844 696 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 SEC24BO95487 1268 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 TNK2Q07912 1038 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 TWF1Q12792 350 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 E2F7Q96AV8 911 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 LXNQ9BS40 222 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 ASAH2Q9NR71 780 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 RGL1Q9NZL6 768 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 VAV3Q9UKW4 847 aa25.98■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.97■■□□□ 1.75
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PRDM4-202ENST00000547188 CAPNS1P04632 268 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 CYP3A7P24462 503 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 POU5F1BQ06416 359 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.97■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 GLRA2P23416 452 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 NECTIN1Q15223 517 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 C4orf19Q8IY42 314 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 INVSQ9Y283 1065 aa25.96■■□□□ 1.75
PRDM4-202ENST00000547188 SLC37A4O43826 429 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 GBP1P32455 592 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 EPHA5P54756 1037 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 PPP2R5CQ13362 524 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM209Q96SK2 561 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 GDAQ9Y2T3 454 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ASXL3Q9C0F0 2248 aa25.95■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 NAV2Q8IVL1 2488 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 A0A1W2PRU2 124 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 TRAPPC3O43617 180 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ARL2P36404 184 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 IRX4P78413 519 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 DYDC2Q96IM9 177 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 GPR88Q9GZN0 384 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 USP20Q9Y2K6 914 aa25.94■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 PI4KAP42356 2102 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CYSRT1A8MQ03 144 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ATG13O75143 517 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CYP4A11Q02928 519 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 UPP1Q16831 310 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ADAM32Q8TC27 787 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ACACAQ13085 2346 aa25.93■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 NLRP5P59047 1200 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 LEMD2Q8NC56 503 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 GON4LQ3T8J9 2241 aa25.92■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 DPYSL4O14531 572 aa25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 RNF40O75150 1001 aa25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 SLC32A1Q9H598 525 aa25.91■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 SCAPQ12770 1279 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 EPHA7Q15375 998 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 TPGS2Q68CL5 300 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 LRRC3Q9BY71 257 aa25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.89■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.89■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 EGFP01133 1207 aa25.89■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa25.89■■□□□ 1.74
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.89■■□□□ 1.74
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